More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1705 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  662    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  48.58 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  49.06 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  45.91 
 
 		 339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.94 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.83 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.51 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  39.52 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.1 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.29 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  36.55 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.66 
 
 		 325 aa  178  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  33.59 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 330 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  32.67 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 348 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  33.47 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  31.2 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  27.99 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 332 aa  155  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  33.07 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 330 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  33.77 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  35.43 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  29.18 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 358 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 347 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 329 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 331 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  28.13 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  30.03 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 340 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 329 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>