More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1650 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  100 
 
 
141 aa  283  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  53.19 
 
 
153 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  51.77 
 
 
153 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  51.77 
 
 
153 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  52.48 
 
 
153 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  52.48 
 
 
153 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  51.06 
 
 
153 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  50.35 
 
 
153 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  52.52 
 
 
142 aa  147  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  48.2 
 
 
143 aa  144  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  47.83 
 
 
143 aa  143  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
154 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
154 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
154 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
154 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
154 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
154 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
154 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  48.59 
 
 
153 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  51.18 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  50 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  50 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  49.65 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  49.29 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  50.36 
 
 
145 aa  136  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  47.48 
 
 
144 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  46.76 
 
 
148 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  45.32 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  47.83 
 
 
142 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  45 
 
 
145 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  44.29 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  45 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  48.57 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  44.6 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  44.6 
 
 
146 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  45.71 
 
 
146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  45 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  46.32 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  43.88 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  44.29 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  45.39 
 
 
146 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  45 
 
 
145 aa  124  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  44.6 
 
 
146 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  41.01 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  43.97 
 
 
146 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  50.85 
 
 
120 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  54.37 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  43.26 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  40.29 
 
 
164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  44.2 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  41.67 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  40.88 
 
 
142 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  43.26 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  41.13 
 
 
155 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  37.41 
 
 
142 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  35.97 
 
 
142 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  38.13 
 
 
142 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  36.69 
 
 
142 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  36.69 
 
 
142 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  38.13 
 
 
142 aa  100  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.43 
 
 
143 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  35.51 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  36.17 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  37.59 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.59 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  38.58 
 
 
142 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  36.43 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  38.52 
 
 
177 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  41.88 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  36.88 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  38.28 
 
 
182 aa  90.9  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  36.88 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  36.17 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  35 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  37.32 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  37.14 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.43 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  32.61 
 
 
145 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  34.04 
 
 
143 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
144 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  35.71 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  35.71 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  38.3 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  35.46 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  31.65 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  37.9 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  32.14 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  37.6 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  34.75 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  33.81 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  34.04 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 
688 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>