More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1620 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  60.27 
 
 		 225 aa  277  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  52.68 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2540  response regulator receiver  39.04 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3534  two-component system response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2732  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3158  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  40.44 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  39.09 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.62 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.62 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.62 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.14 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4016  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.34 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.727043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  38.94 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  36.48 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  39.01 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  39.73 
 
 		 220 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.39 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.05 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 220 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29730  putative two-component response regulator  40.54 
 
 		 223 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.75 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  37.73 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1679  transcriptional regulatory protein PhoP, putative  36.16 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3709  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.16 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140607 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6736  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.523736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  37.22 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  36.65 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  37.67 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2757  response regulator receiver  40.54 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1682  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 260 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000361446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.99 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  36.04 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  38.57 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.17 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.64 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2200  transcriptional regulatory protein YedW  37.56 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000454941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2543  putative two-component response regulator  40.09 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0177943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0914  transcriptional regulatory protein YedW  37.56 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  37.22 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2070  transcriptional regulatory protein YedW  37.56 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.15395e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1676  transcriptional regulatory protein YedW  37.56 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000350308  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2748  transcriptional regulatory protein YedW  37.56 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892088  normal  0.227347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>