More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1611 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
128 aa  262  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  73.44 
 
 
128 aa  205  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  74.22 
 
 
128 aa  199  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  60.16 
 
 
128 aa  159  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 
128 aa  156  7e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 
128 aa  156  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  59.38 
 
 
128 aa  153  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 
131 aa  152  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 
128 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
129 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  58.2 
 
 
129 aa  143  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  58.2 
 
 
133 aa  142  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
129 aa  140  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 
130 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  55.65 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 
130 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
130 aa  134  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  53.72 
 
 
131 aa  133  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
124 aa  133  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 
130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 
129 aa  130  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  130  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 
130 aa  130  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 
130 aa  130  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  48 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  56.2 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  51.2 
 
 
167 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
131 aa  128  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 
130 aa  128  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  54.55 
 
 
132 aa  127  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  46.51 
 
 
129 aa  126  9.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  48.03 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  48.44 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  49.22 
 
 
170 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1598  30S ribosomal protein S9  46.51 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158082  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 
161 aa  124  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 
161 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  48.44 
 
 
159 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  55.37 
 
 
131 aa  125  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  49.18 
 
 
131 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  52.38 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2354  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0958602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  46.4 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  48.76 
 
 
130 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 
161 aa  123  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  45.74 
 
 
129 aa  123  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 
132 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  52.89 
 
 
131 aa  123  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  52.89 
 
 
131 aa  123  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  44.96 
 
 
129 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  49.59 
 
 
130 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  44.96 
 
 
129 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  45.6 
 
 
129 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 
130 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1735  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
131 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0401133 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  44.96 
 
 
129 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  52.07 
 
 
132 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  45.74 
 
 
129 aa  121  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  52.46 
 
 
130 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  49.21 
 
 
161 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 
130 aa  120  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 
130 aa  120  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 
130 aa  120  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 
130 aa  120  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  47.11 
 
 
130 aa  121  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 
130 aa  120  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  46.46 
 
 
162 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 
130 aa  120  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  48.44 
 
 
155 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 
130 aa  120  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  48.44 
 
 
155 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 
158 aa  120  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  50.41 
 
 
130 aa  120  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>