More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1590 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
158 aa  313  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  83.44 
 
 
157 aa  259  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  70.89 
 
 
158 aa  233  8e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 
160 aa  213  6e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  70.06 
 
 
157 aa  212  1e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  65.61 
 
 
157 aa  205  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  62.82 
 
 
158 aa  197  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  60.26 
 
 
157 aa  184  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 
159 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  56.58 
 
 
156 aa  174  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1240  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 
157 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  47.65 
 
 
158 aa  141  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  50 
 
 
159 aa  141  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 
160 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 
157 aa  139  1e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.58219e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 
160 aa  138  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  2.90434e-11  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  46.54 
 
 
172 aa  137  4e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 
159 aa  137  9e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 
152 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 
168 aa  135  3e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  46 
 
 
158 aa  135  3e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 
158 aa  135  3e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  46 
 
 
158 aa  135  3e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  46 
 
 
158 aa  135  3e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 
159 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 
160 aa  134  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 
176 aa  134  7e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  46 
 
 
158 aa  132  1e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  44.3 
 
 
158 aa  133  1e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 
158 aa  133  1e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 
158 aa  132  1e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 
176 aa  132  1e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 
158 aa  132  2e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 
158 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  48 
 
 
158 aa  131  4e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  48 
 
 
158 aa  131  4e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 
158 aa  131  4e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  48.28 
 
 
166 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  48.28 
 
 
166 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  48.28 
 
 
166 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 
158 aa  130  7e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 
158 aa  130  8e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 
158 aa  130  8e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 
158 aa  129  1e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 
158 aa  129  1e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 
158 aa  129  1e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 
158 aa  130  1e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 
158 aa  129  1e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.82345e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 
158 aa  129  1e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 
158 aa  130  1e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
152 aa  129  2e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  45.64 
 
 
158 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  42.95 
 
 
158 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  45.64 
 
 
158 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  46.9 
 
 
157 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 
158 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 
157 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 
158 aa  128  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
158 aa  128  4e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 
158 aa  128  4e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4190  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
158 aa  128  4e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164972  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
158 aa  127  4e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
158 aa  127  5e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.2178e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
158 aa  127  5e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.72965e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
158 aa  127  5e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
157 aa  127  7e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 
158 aa  127  7e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 
158 aa  126  1e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.87405e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
158 aa  126  1e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 
159 aa  126  1e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 
157 aa  126  1e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 
168 aa  126  1e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 
158 aa  126  1e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
158 aa  125  2e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 
160 aa  125  2e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 
163 aa  125  2e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  1.29551e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  42.41 
 
 
158 aa  125  2e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.82493e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 
158 aa  125  2e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 
158 aa  125  2e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 
158 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.53177e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 
160 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 
160 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  43.04 
 
 
158 aa  124  4e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 
159 aa  124  4e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 
158 aa  124  4e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
158 aa  124  4e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.43014e-05  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  41.03 
 
 
173 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 
158 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  46.43 
 
 
162 aa  124  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.11465e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 
159 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>