More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1542 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  52.74 
 
 
294 aa  301  8.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.78 
 
 
302 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0570975  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.85 
 
 
289 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0581  hypothetical protein  35.34 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  32.43 
 
 
298 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  32.99 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 
308 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  28.92 
 
 
312 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  29.39 
 
 
298 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  29.43 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  30.28 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  29.23 
 
 
310 aa  95.5  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  30.1 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  26.88 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 
313 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  29.55 
 
 
310 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.87 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.62 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  27.53 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  27.62 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  27.53 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  25.87 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  29.55 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  29.55 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  28.87 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  27.14 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  29.21 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  28.16 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  28.24 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  25.61 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  28.93 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  27.82 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.35 
 
 
300 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  26.09 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  26.04 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  27.05 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  26.86 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  28.52 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  29.14 
 
 
334 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  26.33 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  26.33 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  26.33 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  24.47 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  29.15 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  28.38 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  27.05 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  27.05 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.84 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  27.43 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  28.67 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  25.9 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.44 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  25.54 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  25.81 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.25 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  28.79 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  28.16 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4446  hypothetical protein  29.14 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  25.71 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.15 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  29.68 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.48 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.48 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  29.79 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.48 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.48 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.82 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.82 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.48 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.48 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  26.86 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.35 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.82 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  25.69 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.83 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  27.51 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  27.02 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  26.84 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.84 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3207  hypothetical protein  28.78 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4953  hypothetical protein  28.78 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  27.34 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  27.8 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  25.36 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>