More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1532 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  70.62 
 
 		 516 aa  771    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  69.59 
 
 		 514 aa  739    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  100 
 
 		 543 aa  1107    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  53.05 
 
 		 516 aa  551  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  53.01 
 
 		 520 aa  551  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  50.29 
 
 		 520 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  50.78 
 
 		 535 aa  518  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  50.7 
 
 		 504 aa  505  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  49.22 
 
 		 516 aa  498  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  51.76 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  36.38 
 
 		 565 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  35.57 
 
 		 562 aa  342  8e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  35.55 
 
 		 570 aa  334  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  35.73 
 
 		 568 aa  331  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  37.18 
 
 		 551 aa  323  5e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  35.64 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  35.78 
 
 		 566 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  40.88 
 
 		 604 aa  296  9e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  38.7 
 
 		 525 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  34.33 
 
 		 559 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  33 
 
 		 494 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  34.52 
 
 		 503 aa  269  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  36.69 
 
 		 564 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  32.77 
 
 		 512 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  36.39 
 
 		 990 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  36.08 
 
 		 531 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  34.35 
 
 		 562 aa  260  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  35.73 
 
 		 496 aa  259  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37 
 
 		 503 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  34.69 
 
 		 908 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  34.7 
 
 		 702 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  39.71 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  35.52 
 
 		 496 aa  257  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  34.84 
 
 		 489 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  34.03 
 
 		 636 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  34.7 
 
 		 1007 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  35.18 
 
 		 1194 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  33.94 
 
 		 489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  33.94 
 
 		 489 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  34.52 
 
 		 457 aa  253  6e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  34.04 
 
 		 496 aa  253  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  34.04 
 
 		 496 aa  253  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  35.25 
 
 		 1043 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  34.7 
 
 		 1265 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  37.77 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  33.98 
 
 		 922 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  35.1 
 
 		 1117 aa  247  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  34.12 
 
 		 944 aa  246  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  34.38 
 
 		 1427 aa  246  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  34.94 
 
 		 1041 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  32.08 
 
 		 543 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  37.41 
 
 		 517 aa  243  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0321  ribonuclease  33.97 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.691253  normal  0.292271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  33.65 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0537  ribonuclease E  35.4 
 
 		 486 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2376  ribonuclease, Rne/Rng family  35.45 
 
 		 491 aa  241  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  31.55 
 
 		 411 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  35.25 
 
 		 687 aa  240  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  35.51 
 
 		 713 aa  239  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  33.92 
 
 		 497 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  33.73 
 
 		 1018 aa  239  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  34.2 
 
 		 1070 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  35.41 
 
 		 499 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  34.04 
 
 		 571 aa  238  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  36.09 
 
 		 500 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  33.09 
 
 		 1334 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  31.37 
 
 		 1093 aa  236  7e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  32.92 
 
 		 496 aa  236  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  32.07 
 
 		 1244 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  33.09 
 
 		 974 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  34.99 
 
 		 645 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  31.38 
 
 		 537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  34.13 
 
 		 501 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  32.48 
 
 		 483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  31.46 
 
 		 1022 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  35.53 
 
 		 503 aa  233  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  32.64 
 
 		 490 aa  233  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  32.29 
 
 		 485 aa  233  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  32.77 
 
 		 717 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  35.4 
 
 		 653 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  35.4 
 
 		 653 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  34.45 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  34.96 
 
 		 741 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  33.01 
 
 		 487 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  32.61 
 
 		 1113 aa  233  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2218  ribonuclease  35.55 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.513685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2339  ribonuclease  35.55 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0414308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  34.84 
 
 		 602 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  32.94 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  35.31 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  33.97 
 
 		 497 aa  231  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  35.55 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  35.55 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  35.55 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  35.55 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  34.88 
 
 		 808 aa  230  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0656  ribonuclease E  34.29 
 
 		 998 aa  230  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3349  ribonuclease, Rne/Rng family  35.31 
 
 		 490 aa  229  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  33.73 
 
 		 497 aa  229  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  32.14 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>