More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1455 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  55.74 
 
 
619 aa  694    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  60.78 
 
 
622 aa  777    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
657 aa  1344    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  46.07 
 
 
600 aa  505  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.51 
 
 
651 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  41.25 
 
 
596 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  40.21 
 
 
664 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  41.64 
 
 
648 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  40.98 
 
 
621 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3202  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.89 
 
 
654 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000159747  normal  0.0376991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  35.13 
 
 
610 aa  352  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  34.84 
 
 
640 aa  335  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  35.74 
 
 
615 aa  332  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 
643 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.75 
 
 
639 aa  324  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 
646 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 
645 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  32.46 
 
 
647 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  31.32 
 
 
641 aa  301  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.83 
 
 
647 aa  299  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
642 aa  297  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 
634 aa  289  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 
643 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
636 aa  286  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 
664 aa  280  5e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
646 aa  280  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  32.76 
 
 
640 aa  276  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 
662 aa  274  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  33.11 
 
 
681 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 
633 aa  267  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 
678 aa  267  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  32.13 
 
 
673 aa  266  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 
636 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 
634 aa  264  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 
627 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  29.98 
 
 
801 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 
793 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 
632 aa  258  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 
618 aa  256  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  29.98 
 
 
619 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 
611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  30.98 
 
 
803 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 
650 aa  254  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  30.98 
 
 
803 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  30.98 
 
 
809 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 
645 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 
802 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 
802 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 
802 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 
802 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 
802 aa  252  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  31.25 
 
 
756 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 
766 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  31.14 
 
 
775 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 
764 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 
630 aa  250  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  30.93 
 
 
760 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 
765 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 
646 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 
765 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  31.15 
 
 
618 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  29.19 
 
 
703 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  31.51 
 
 
800 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 
646 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  30.63 
 
 
627 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 
618 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 
761 aa  248  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
597 aa  247  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 
618 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 
618 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.17 
 
 
629 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 
618 aa  247  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 
648 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  29.13 
 
 
602 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.77 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  29.13 
 
 
602 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  31.27 
 
 
618 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  29.87 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  30.35 
 
 
801 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 
646 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 
609 aa  245  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 
691 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 
629 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 
630 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 
643 aa  243  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  30.37 
 
 
801 aa  243  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  29.88 
 
 
628 aa  243  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.33 
 
 
631 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 
618 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 
648 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 
648 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 
610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
618 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
618 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 
618 aa  241  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
618 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  30.84 
 
 
618 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  30.96 
 
 
635 aa  240  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  31.44 
 
 
635 aa  240  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>