69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1362 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 
124 aa  253  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  74.59 
 
 
123 aa  196  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  65.57 
 
 
155 aa  169  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  44.25 
 
 
124 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  41.23 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  40.71 
 
 
125 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  37.39 
 
 
123 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  39.34 
 
 
122 aa  100  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  43.52 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  37.61 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  34.75 
 
 
120 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  39.64 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  29.91 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  28.81 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  31.62 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  30.17 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  30.17 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  29.06 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  30.08 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  25.44 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  27.83 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  28.45 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  29.51 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  24.76 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  26.27 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  31.67 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  27.19 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  28.21 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  21.74 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  25.42 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  26.98 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  26.98 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  27.05 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  31.4 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  30.58 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  26.98 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  28.81 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  26.98 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  26.98 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  31.4 
 
 
146 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  25.42 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  24.8 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  24.56 
 
 
130 aa  50.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  24 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  23.89 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  24.37 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  29.09 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  24.35 
 
 
131 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  23.68 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  27.47 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  23.01 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  24.19 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  24.35 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  24.8 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  24.35 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  23.33 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  24.35 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  22.41 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  25.86 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  22.4 
 
 
127 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  23.28 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  25.58 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  25.49 
 
 
126 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  24.55 
 
 
123 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  25.49 
 
 
126 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>