147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1353 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 451 aa  914    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  30.75 
 
 		 435 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6121  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 439 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 		 470 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 635 aa  77  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  21.06 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  19.71 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  20.82 
 
 		 731 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.6 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  18.26 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  19.8 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  20.35 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  20.68 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  20.72 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.02 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  19.24 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0058  putative type I toxin secretion system, outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  18.73 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  19.77 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  20.04 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  20.42 
 
 		 1470 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  21.19 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  19.87 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  20.72 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  20.7 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  19.7 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.18 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  20.65 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  17.52 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  18.7 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  21.32 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  20.87 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  20.58 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  20.14 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  20.73 
 
 		 489 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6010  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 462 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 364 aa  57  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  20.73 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  21.13 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 		 451 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  19.77 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  20.57 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  19.35 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  19.71 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  21.61 
 
 		 576 aa  54.3  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 448 aa  53.9  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  19.51 
 
 		 445 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  25.96 
 
 		 574 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 455 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  21.03 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  20.14 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  19.9 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  19.24 
 
 		 972 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  24.89 
 
 		 574 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  20.66 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  19.33 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  20.81 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  18.39 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  19.81 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>