More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1343 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1343  thioredoxin  100 
 
 
105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  83.81 
 
 
105 aa  186  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  73.33 
 
 
106 aa  174  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  64.76 
 
 
105 aa  152  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  63.81 
 
 
104 aa  140  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  56.86 
 
 
110 aa  135  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  53.85 
 
 
106 aa  130  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  56.19 
 
 
105 aa  128  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  52.43 
 
 
115 aa  127  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  52.43 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  56.86 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  54.29 
 
 
105 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  51.92 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  50 
 
 
114 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  55 
 
 
109 aa  123  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  52.43 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  53.4 
 
 
108 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  52 
 
 
109 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  48.57 
 
 
107 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  50.48 
 
 
107 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  51.96 
 
 
106 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  56.44 
 
 
106 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  56.44 
 
 
106 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  48.57 
 
 
123 aa  121  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  120  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  120  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  52.53 
 
 
108 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  52.53 
 
 
108 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  52.53 
 
 
108 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  52.53 
 
 
108 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  49.04 
 
 
107 aa  120  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  55.45 
 
 
106 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  56.38 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  50.5 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  55.56 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  50.49 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  48.08 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  51 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  51.43 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  52.53 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  49 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  52.43 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  47.57 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  48.51 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  54 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  48.51 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  52 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  45.71 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  50.51 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  48.08 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  48.08 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  51.43 
 
 
107 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  46.6 
 
 
113 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  50.51 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  50.51 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  48.48 
 
 
108 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  50.51 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  51.52 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  48.08 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  49.04 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  48.08 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  49.49 
 
 
109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  47.12 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  47.12 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>