More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1287 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  28.84 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 		 309 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.98 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 271 aa  92  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.22 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 		 281 aa  89  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 256 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.29 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  26.2 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  25.78 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  22.75 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  25.58 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.69 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  29.44 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  22.8 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  22.94 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  19.85 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  23.92 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  25.1 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  22.87 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  25.81 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  41.86 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  24.52 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.64 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  22.77 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  20.55 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.46 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  28.88 
 
 		 306 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  28.34 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  39.29 
 
 		 1366 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  21.92 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.43 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  23.14 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  22.29 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.03 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  22.94 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.94 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  34.52 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  21.31 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  24.45 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>