34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1261 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  796    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  49.39 
 
 		 415 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  48.63 
 
 		 415 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  46.86 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 409 aa  276  5e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  25.56 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 406 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  25.68 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  22.07 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  22.07 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  27.75 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  27.75 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  27.75 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  23.5 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  23.45 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  23.1 
 
 		 423 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>