298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1189 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  55.73 
 
 		 1389 aa  883    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  100 
 
 		 1679 aa  3343    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  47.58 
 
 		 461 aa  342  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  48.4 
 
 		 461 aa  337  7.999999999999999e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  50.93 
 
 		 1919 aa  331  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.81 
 
 		 821 aa  327  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  44.97 
 
 		 911 aa  313  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  43.87 
 
 		 807 aa  309  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  42.86 
 
 		 547 aa  301  9e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.29 
 
 		 818 aa  298  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  37.75 
 
 		 2082 aa  270  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  36.91 
 
 		 631 aa  230  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  39.68 
 
 		 784 aa  227  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  39.82 
 
 		 717 aa  225  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  35.82 
 
 		 743 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  38.3 
 
 		 449 aa  221  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  39.72 
 
 		 778 aa  219  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  40.31 
 
 		 714 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.63 
 
 		 469 aa  216  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  35.17 
 
 		 363 aa  209  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  35.17 
 
 		 363 aa  209  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  38.35 
 
 		 1129 aa  203  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  38.68 
 
 		 792 aa  201  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  38.64 
 
 		 776 aa  201  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.43 
 
 		 417 aa  195  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.15 
 
 		 837 aa  193  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  44.94 
 
 		 401 aa  190  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  35.33 
 
 		 553 aa  190  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.67 
 
 		 692 aa  190  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.34 
 
 		 563 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  34.86 
 
 		 593 aa  187  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  36.89 
 
 		 477 aa  187  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.14 
 
 		 554 aa  186  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  33.94 
 
 		 618 aa  185  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.69 
 
 		 1848 aa  185  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  35.46 
 
 		 726 aa  181  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  35.14 
 
 		 558 aa  179  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  35.22 
 
 		 569 aa  178  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  32.22 
 
 		 551 aa  177  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  38.81 
 
 		 577 aa  176  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.18 
 
 		 553 aa  176  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  31.98 
 
 		 546 aa  174  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  32.56 
 
 		 579 aa  174  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  34.19 
 
 		 560 aa  173  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.73 
 
 		 561 aa  171  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.01 
 
 		 567 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.75 
 
 		 556 aa  164  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  37.05 
 
 		 376 aa  162  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  36.47 
 
 		 389 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  45.97 
 
 		 484 aa  160  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.67 
 
 		 555 aa  159  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  31.33 
 
 		 554 aa  159  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  33.14 
 
 		 681 aa  159  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  33.89 
 
 		 403 aa  159  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  37.07 
 
 		 566 aa  156  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  35.4 
 
 		 835 aa  155  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.53 
 
 		 570 aa  155  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  33.43 
 
 		 558 aa  154  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  40 
 
 		 386 aa  153  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  54.89 
 
 		 1222 aa  152  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.01 
 
 		 706 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.68 
 
 		 1126 aa  149  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  32.6 
 
 		 443 aa  147  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.95 
 
 		 555 aa  147  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  40.97 
 
 		 479 aa  142  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  39.48 
 
 		 424 aa  139  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.5 
 
 		 810 aa  138  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.51 
 
 		 737 aa  138  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  37.55 
 
 		 452 aa  137  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  26.92 
 
 		 341 aa  132  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  39.81 
 
 		 318 aa  131  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  28.41 
 
 		 816 aa  130  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  30.4 
 
 		 900 aa  130  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  29.55 
 
 		 597 aa  125  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  31.17 
 
 		 328 aa  125  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 396 aa  125  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  39.64 
 
 		 277 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  27.79 
 
 		 418 aa  122  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  33.81 
 
 		 618 aa  122  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  26.77 
 
 		 1207 aa  121  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.43 
 
 		 787 aa  119  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  40.85 
 
 		 428 aa  119  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  31.56 
 
 		 581 aa  117  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  29.17 
 
 		 1187 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.54 
 
 		 817 aa  112  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 745 aa  111  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  30.97 
 
 		 544 aa  111  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.9 
 
 		 941 aa  110  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  31.04 
 
 		 416 aa  109  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  30.51 
 
 		 624 aa  108  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  41.82 
 
 		 2402 aa  106  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  27.41 
 
 		 399 aa  104  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  30.77 
 
 		 332 aa  104  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  26.15 
 
 		 575 aa  103  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  31.18 
 
 		 586 aa  103  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.61 
 
 		 535 aa  103  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  27.21 
 
 		 558 aa  101  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1059 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  33.59 
 
 		 638 aa  100  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.58 
 
 		 454 aa  100  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>