More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1166 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  708    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  50.57 
 
 
348 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  45.62 
 
 
333 aa  292  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  44.97 
 
 
337 aa  282  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  41.23 
 
 
344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  40.94 
 
 
346 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.9 
 
 
346 aa  252  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  37.57 
 
 
348 aa  251  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  37.57 
 
 
348 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  36.81 
 
 
349 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  38.51 
 
 
349 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  38.51 
 
 
349 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  38.51 
 
 
349 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.18 
 
 
343 aa  242  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  38.94 
 
 
348 aa  242  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  37.76 
 
 
347 aa  239  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.81 
 
 
343 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.81 
 
 
343 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.02 
 
 
343 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  38.08 
 
 
346 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.81 
 
 
343 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.81 
 
 
343 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  38.28 
 
 
350 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.73 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.73 
 
 
343 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.36 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  38.99 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  36.34 
 
 
346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  35.73 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  37.79 
 
 
346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  37.57 
 
 
346 aa  232  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  35.73 
 
 
349 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  35.94 
 
 
343 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  36.76 
 
 
350 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  36.42 
 
 
336 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  37.2 
 
 
346 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  36.61 
 
 
360 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  35.88 
 
 
374 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  36.47 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  35.55 
 
 
346 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  35.55 
 
 
346 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  35.55 
 
 
346 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  35.47 
 
 
346 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  35.36 
 
 
359 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  35.47 
 
 
346 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  35.47 
 
 
346 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  35.36 
 
 
359 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  35.47 
 
 
346 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  35.26 
 
 
346 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  35.47 
 
 
346 aa  222  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  35.07 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  35.26 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  37.95 
 
 
336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  36.63 
 
 
345 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  38.46 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.46 
 
 
350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  38.39 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  38.05 
 
 
358 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  38.05 
 
 
358 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  35.8 
 
 
346 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  35.24 
 
 
349 aa  209  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3878  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 
349 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  36.08 
 
 
360 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.66 
 
 
350 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  38.66 
 
 
350 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 
361 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  34.66 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
350 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.08 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.08 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.08 
 
 
350 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  34.94 
 
 
363 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.08 
 
 
350 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  33.62 
 
 
357 aa  196  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  38.08 
 
 
350 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0050  dehydrogenase or related protein  36.62 
 
 
340 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 
346 aa  193  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  38.39 
 
 
350 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.72 
 
 
353 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.01 
 
 
353 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.53 
 
 
353 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.82 
 
 
353 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  33.24 
 
 
353 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  38.39 
 
 
350 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  38.39 
 
 
350 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.72 
 
 
353 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.72 
 
 
353 aa  188  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3327  oxidoreductase-like  38.58 
 
 
350 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  33.72 
 
 
339 aa  186  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  34.78 
 
 
345 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  35.07 
 
 
345 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0161  oxidoreductase domain-containing protein  38.67 
 
 
341 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  34.78 
 
 
345 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 
345 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  34.78 
 
 
345 aa  185  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  34.78 
 
 
345 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  34.49 
 
 
345 aa  185  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  34.2 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1980  oxidoreductase domain-containing protein  34.32 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>