More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1151 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1151  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 265 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2022  transcriptional regulator, AraC family  40.35 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0521834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  36.5 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  24.48 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  23.26 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.25 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  23.61 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  25.58 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  22.78 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  21.07 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5369  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4352  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00646909  normal  0.121153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  21.4 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  33.67 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  23.31 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  22.22 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  31.63 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1007  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 517 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  20.85 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  20.97 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  21.97 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  20.16 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  20.7 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  27.55 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  30.68 
 
 		 961 aa  59.7  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  20.77 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  35.44 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 409 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 409 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  21.89 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2973  AraC family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.85 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  25.22 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6183  transcriptional regulator, AraC family  29.23 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0614415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>