66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1146 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  31.35 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  35.91 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  32.93 
 
 
188 aa  92  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  35.93 
 
 
178 aa  91.3  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  31.22 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  27.08 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  29.84 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  29.47 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  28.8 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  28.65 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  26.84 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  30.59 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  29.47 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  27.18 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  29.1 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  27.23 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  27.23 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  30.39 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  27.23 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  27.23 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  29.7 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  24.47 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  28.18 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  28.18 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  28.18 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  26.11 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  27.03 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  26.11 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  28.33 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3371  hypothetical protein  25.43 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  27.07 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  32.09 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  25 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  24.74 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  27.49 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  26.54 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  24.24 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  23.6 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  24.73 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  24.6 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  24.18 
 
 
172 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  28.65 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  24.62 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  24.31 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  25.84 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  25.84 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  25.71 
 
 
178 aa  48.5  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  24.58 
 
 
178 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  24.58 
 
 
178 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  24.58 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  24.58 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  27.75 
 
 
186 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  27.07 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  25.62 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  24.57 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  23.6 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  24.57 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  24.72 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  24.72 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  26.52 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  22.81 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  25.37 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  25.54 
 
 
175 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  23.43 
 
 
189 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0554174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>