More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1141 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  66.25 
 
 		 488 aa  669    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  100 
 
 		 477 aa  981    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  71.28 
 
 		 476 aa  719    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  47.68 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  46.38 
 
 		 479 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2321  pyruvate kinase  45.01 
 
 		 496 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  47.19 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  42.58 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  42.33 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  43.4 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  44.01 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  44.1 
 
 		 597 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  43.91 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  43.46 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  41.79 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  41.79 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  43.01 
 
 		 596 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  42.08 
 
 		 605 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  44.23 
 
 		 596 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  42.62 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  41.89 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  42.59 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  41.27 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.23 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  44.01 
 
 		 596 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  44.33 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  41.7 
 
 		 594 aa  363  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  41.86 
 
 		 578 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.44 
 
 		 580 aa  362  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  40.51 
 
 		 583 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  40.17 
 
 		 474 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  40.38 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  41.18 
 
 		 588 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  42.74 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  41.26 
 
 		 480 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  42.62 
 
 		 480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  42.14 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  40.26 
 
 		 580 aa  356  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  38.99 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  40.71 
 
 		 477 aa  356  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  42.71 
 
 		 474 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  41.36 
 
 		 582 aa  355  8.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  41.15 
 
 		 478 aa  354  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  42.32 
 
 		 476 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  41.47 
 
 		 589 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  41.23 
 
 		 471 aa  353  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  41.61 
 
 		 590 aa  353  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  40.51 
 
 		 481 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  41.3 
 
 		 585 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  41.3 
 
 		 585 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  41.3 
 
 		 585 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  41.37 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  41.42 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  41.42 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  41.92 
 
 		 587 aa  350  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  40.3 
 
 		 481 aa  350  3e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  40.92 
 
 		 601 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  41.09 
 
 		 585 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  42.07 
 
 		 470 aa  350  5e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  41.36 
 
 		 592 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 472 aa  349  6e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  41.36 
 
 		 592 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 472 aa  349  6e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 472 aa  349  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  41.09 
 
 		 585 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  41.09 
 
 		 585 aa  349  7e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  41.09 
 
 		 585 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  41.09 
 
 		 585 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  40.8 
 
 		 583 aa  349  7e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  41.09 
 
 		 585 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  40.58 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  40.17 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  41 
 
 		 587 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  40.97 
 
 		 474 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  41.61 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  40.88 
 
 		 585 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 487 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  39.62 
 
 		 472 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  40.42 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  40.25 
 
 		 477 aa  347  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  39.15 
 
 		 584 aa  346  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  41.44 
 
 		 470 aa  346  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 472 aa  346  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  40.21 
 
 		 470 aa  346  6e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  41.23 
 
 		 471 aa  345  8e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1664  pyruvate kinase  41.26 
 
 		 469 aa  345  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000486614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  40.46 
 
 		 585 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  40.76 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  41.58 
 
 		 600 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  40 
 
 		 474 aa  342  8e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  39.71 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  39.45 
 
 		 582 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  40.33 
 
 		 478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1749  pyruvate kinase  41.01 
 
 		 470 aa  338  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.39981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1855  pyruvate kinase  41.01 
 
 		 470 aa  338  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000869854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2582  pyruvate kinase  41.01 
 
 		 470 aa  338  9e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00785837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  38.64 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>