239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1067 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  100 
 
 
417 aa  845  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  44.12 
 
 
407 aa  341  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  40.9 
 
 
422 aa  295  7e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  33.98 
 
 
418 aa  201  2e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  30.51 
 
 
412 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  33.64 
 
 
429 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  31.59 
 
 
446 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  29.39 
 
 
475 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  27.74 
 
 
419 aa  175  1e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  25.59 
 
 
431 aa  149  1e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.14 
 
 
394 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  37.5 
 
 
490 aa  115  1e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  26.39 
 
 
436 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  25.06 
 
 
400 aa  99.8  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.40238e-08  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  22.01 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  22.11 
 
 
465 aa  93.2  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  22.94 
 
 
503 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  24.01 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  21.19 
 
 
503 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  26.3 
 
 
397 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  23.13 
 
 
495 aa  86.3  1e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26.3 
 
 
397 aa  84  4e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  24.88 
 
 
516 aa  84  5e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  3.8172e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  24.69 
 
 
416 aa  81.3  3e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  26.78 
 
 
396 aa  80.9  4e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.44038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  23.28 
 
 
404 aa  79  2e-13  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  32.85 
 
 
372 aa  75.1  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  22.25 
 
 
404 aa  73.2  8e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.21707e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  30.83 
 
 
375 aa  71.2  3e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.52343e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  24.24 
 
 
434 aa  70.1  8e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  30.66 
 
 
373 aa  69.7  9e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  29.9 
 
 
420 aa  69.7  1e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  30.66 
 
 
372 aa  69.3  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.7 
 
 
376 aa  68.2  3e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.73675e-08  hitchhiker  4.27958e-09 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  26.65 
 
 
455 aa  67.8  4e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25.89 
 
 
440 aa  67.4  4e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  28.24 
 
 
438 aa  67  5e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  22.12 
 
 
428 aa  67.4  5e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  22.43 
 
 
372 aa  67  6e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  20.71 
 
 
398 aa  66.6  7e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.18753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  27.56 
 
 
414 aa  66.2  1e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  30.94 
 
 
388 aa  65.9  1e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  26.95 
 
 
438 aa  65.1  2e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  26.95 
 
 
438 aa  65.1  2e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  29.77 
 
 
387 aa  65.1  2e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  31.54 
 
 
379 aa  65.5  2e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  26.27 
 
 
428 aa  65.1  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  27.98 
 
 
420 aa  65.5  2e-09  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  24.62 
 
 
377 aa  64.7  3e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  27.52 
 
 
370 aa  64.3  4e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  24.22 
 
 
381 aa  64.3  4e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  25.19 
 
 
456 aa  63.9  5e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  23.6 
 
 
379 aa  63.5  6e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  25.19 
 
 
456 aa  63.5  6e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  24.74 
 
 
456 aa  63.5  7e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  26.32 
 
 
387 aa  63.5  7e-09  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  27.07 
 
 
366 aa  62.8  1e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  24.68 
 
 
430 aa  62.8  1e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.6431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  22.28 
 
 
441 aa  62.8  1e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  27.74 
 
 
405 aa  62  2e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  27.7 
 
 
382 aa  61.6  2e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  24.85 
 
 
404 aa  61.2  3e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  36.89 
 
 
305 aa  59.3  1e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  6.81555e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  30.23 
 
 
379 aa  57.4  4e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  25.96 
 
 
433 aa  57.4  4e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  24.69 
 
 
374 aa  57.8  4e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.67566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  32.28 
 
 
440 aa  57.8  4e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  32.28 
 
 
440 aa  57.8  4e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  32.28 
 
 
437 aa  57  7e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  27.86 
 
 
446 aa  56.6  9e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  30.61 
 
 
417 aa  55.8  1e-06  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  26.67 
 
 
377 aa  55.8  1e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  29.23 
 
 
346 aa  56.2  1e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  21.24 
 
 
362 aa  55.5  2e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5395e-07 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  27.69 
 
 
374 aa  55.1  2e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  22.12 
 
 
362 aa  54.7  3e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.29234e-05 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  26.36 
 
 
382 aa  53.9  5e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  23.24 
 
 
378 aa  53.9  5e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  29.92 
 
 
465 aa  53.9  5e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  25.53 
 
 
382 aa  53.5  6e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  30.43 
 
 
286 aa  53.5  7e-06  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  30.37 
 
 
475 aa  53.5  7e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.38116e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  27.91 
 
 
419 aa  53.5  7e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  24.9 
 
 
426 aa  53.1  8e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  31.4 
 
 
314 aa  53.1  8e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  30.13 
 
 
465 aa  53.1  8e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  22.57 
 
 
444 aa  53.1  8e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  26.79 
 
 
388 aa  53.1  8e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  29.92 
 
 
332 aa  53.1  9e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  26.83 
 
 
299 aa  53.1  9e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  2.50462e-08 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  24.85 
 
 
375 aa  53.1  9e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  22.76 
 
 
424 aa  52.4  1e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  25.19 
 
 
458 aa  52.8  1e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  30.08 
 
 
398 aa  52.8  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.84 
 
 
304 aa  52.4  1e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  21.24 
 
 
362 aa  52.4  1e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  25.58 
 
 
375 aa  52.4  1e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  21.38 
 
 
377 aa  51.6  2e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  1.59575e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  22.26 
 
 
362 aa  52  2e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  28.93 
 
 
457 aa  52  2e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>