105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1022 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  100 
 
 
465 aa  955    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  70.9 
 
 
1152 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  38.77 
 
 
1223 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  39.07 
 
 
477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  37.47 
 
 
460 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  39.46 
 
 
2690 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  28.57 
 
 
543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  30.79 
 
 
609 aa  136  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  28.29 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  30.32 
 
 
571 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  28.92 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  28.92 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  28.64 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  28.87 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  28.89 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  28.92 
 
 
453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  28.68 
 
 
453 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  27.6 
 
 
408 aa  116  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 
511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  27.25 
 
 
691 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  30.12 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  25.82 
 
 
1748 aa  90.5  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 
430 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  29.07 
 
 
432 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
1129 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  28.19 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  29.84 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
1140 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
1140 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
1140 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  23.55 
 
 
477 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 
912 aa  70.5  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 
376 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  27.35 
 
 
429 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2710  chitosanase  32.5 
 
 
171 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0388381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  27.96 
 
 
337 aa  61.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  25.59 
 
 
393 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  26.03 
 
 
377 aa  58.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  26.47 
 
 
330 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  25.64 
 
 
332 aa  58.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 
381 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  27.02 
 
 
332 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  26.69 
 
 
2772 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  24.62 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  24.31 
 
 
514 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  24.9 
 
 
493 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  25 
 
 
506 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  24.31 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  25 
 
 
506 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  24.31 
 
 
508 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  25 
 
 
520 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  26.77 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  24.87 
 
 
376 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  25.42 
 
 
393 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  25.87 
 
 
393 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  26.09 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  23.36 
 
 
409 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  23.36 
 
 
409 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  23.36 
 
 
409 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  24.37 
 
 
392 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  30.71 
 
 
2807 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  24.91 
 
 
371 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  23.91 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  28.12 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  30.84 
 
 
1070 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  26.7 
 
 
344 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 
292 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  26.91 
 
 
372 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  36.71 
 
 
742 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  22.19 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  23.33 
 
 
409 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  24.29 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 
1337 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  31.58 
 
 
1394 aa  47  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  26.83 
 
 
461 aa  47  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  25.43 
 
 
419 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  27.56 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  25 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  23.22 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  25.84 
 
 
348 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  35.56 
 
 
874 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  23.83 
 
 
371 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  33.33 
 
 
367 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  21.94 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  23.33 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  24.71 
 
 
370 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  24.15 
 
 
369 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  24.15 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  24.15 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  24.15 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  24.15 
 
 
369 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  31.17 
 
 
811 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  25.11 
 
 
365 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  33.33 
 
 
384 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  25.11 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  37.84 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  25.11 
 
 
365 aa  43.9  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  25.11 
 
 
370 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>