More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1021 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 761 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 707 aa  1435    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  50.69 
 
 		 740 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  53.81 
 
 		 713 aa  738    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1507  RNA-binding S1 domain-containing protein  48 
 
 		 794 aa  662    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.42 
 
 		 759 aa  691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  48.36 
 
 		 710 aa  681    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  53.78 
 
 		 775 aa  723    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  53.19 
 
 		 754 aa  751    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  55.43 
 
 		 705 aa  761    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  54.2 
 
 		 760 aa  765    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.42 
 
 		 788 aa  719    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  46.47 
 
 		 756 aa  645    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  67.85 
 
 		 707 aa  1006    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.52 
 
 		 723 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  47.45 
 
 		 757 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.13 
 
 		 723 aa  632  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  46.66 
 
 		 773 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  47.06 
 
 		 762 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  47.05 
 
 		 754 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  46.83 
 
 		 759 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  46.03 
 
 		 718 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  47.33 
 
 		 756 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  44.09 
 
 		 784 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  43.65 
 
 		 802 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.99 
 
 		 780 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  45.68 
 
 		 767 aa  600  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  45.19 
 
 		 722 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.39 
 
 		 787 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  45.13 
 
 		 766 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  44.63 
 
 		 773 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.59 
 
 		 787 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  45.97 
 
 		 719 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  43.45 
 
 		 787 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  45.97 
 
 		 719 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.32 
 
 		 779 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.91 
 
 		 779 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  44.86 
 
 		 763 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.45 
 
 		 787 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  43.73 
 
 		 774 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  43.73 
 
 		 774 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  45.33 
 
 		 772 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  43.73 
 
 		 774 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.67 
 
 		 804 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.34 
 
 		 787 aa  595  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  44.92 
 
 		 799 aa  595  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  43.23 
 
 		 787 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  43.73 
 
 		 774 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.78 
 
 		 813 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.2 
 
 		 757 aa  595  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.91 
 
 		 779 aa  595  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  43.73 
 
 		 774 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  43.73 
 
 		 774 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  43.87 
 
 		 782 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  44.15 
 
 		 778 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.81 
 
 		 802 aa  591  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  44.97 
 
 		 777 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  43.73 
 
 		 821 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.88 
 
 		 774 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.87 
 
 		 781 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  45.1 
 
 		 720 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  43.98 
 
 		 788 aa  589  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  45.01 
 
 		 773 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  44.97 
 
 		 720 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1460  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.12 
 
 		 773 aa  586  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0675238  normal  0.590936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  43.94 
 
 		 777 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.43 
 
 		 812 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  44.26 
 
 		 773 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  44.55 
 
 		 776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  43.13 
 
 		 779 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.65 
 
 		 726 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  44.08 
 
 		 788 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  44.26 
 
 		 773 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.29 
 
 		 815 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  44.6 
 
 		 772 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  45.4 
 
 		 719 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  43.06 
 
 		 765 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.26 
 
 		 773 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.08 
 
 		 803 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  45.8 
 
 		 718 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  44.55 
 
 		 776 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  44.29 
 
 		 815 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  43.65 
 
 		 772 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3811  putative transcriptional accessory protein  44.55 
 
 		 776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.29 
 
 		 774 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  44.55 
 
 		 776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  44.26 
 
 		 773 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  44.55 
 
 		 776 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.88 
 
 		 772 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  44.28 
 
 		 772 aa  582  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  44.26 
 
 		 773 aa  582  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  42.52 
 
 		 796 aa  579  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  44.14 
 
 		 773 aa  581  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  44.26 
 
 		 773 aa  581  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.01 
 
 		 813 aa  581  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  44.26 
 
 		 773 aa  581  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  43.59 
 
 		 775 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  44.44 
 
 		 772 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1368  transcription-related protein  42.74 
 
 		 772 aa  582  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.01 
 
 		 774 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>