More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1012 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 		 552 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 562 aa  653    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 556 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 567 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 555 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 566 aa  684    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 		 567 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 556 aa  637    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 569 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  61.07 
 
 		 564 aa  697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 		 555 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 564 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 555 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 567 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  70.81 
 
 		 555 aa  839    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 555 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 561 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 555 aa  737    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 566 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1133  glutaminyl-tRNA synthetase  73.29 
 
 		 579 aa  875    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.613915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 572 aa  663    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 568 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 		 565 aa  658    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 		 555 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 565 aa  636    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 		 555 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 705 aa  1456    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 569 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 587 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 		 556 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 580 aa  655    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 556 aa  652    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 570 aa  646    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  61.15 
 
 		 556 aa  703    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 565 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 558 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 552 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 552 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 		 555 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  61.25 
 
 		 570 aa  692    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 552 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 589 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 555 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 563 aa  663    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 565 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 		 555 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 564 aa  655    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 		 567 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 554 aa  633  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 		 554 aa  634  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 565 aa  634  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  57.07 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 565 aa  632  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 563 aa  628  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 554 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 553 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 554 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 558 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 568 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 552 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 559 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 552 aa  625  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 576 aa  624  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 556 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 561 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 561 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 560 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 561 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 551 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 552 aa  617  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 559 aa  618  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 580 aa  617  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 551 aa  614  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 557 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 559 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 583 aa  614  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 580 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 540 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 576 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 573 aa  612  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 557 aa  611  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 		 553 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 576 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 556 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 556 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 556 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 558 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 556 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 573 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 565 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>