287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0797 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 
206 aa  430  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  44.88 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  42.36 
 
 
232 aa  171  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  42.36 
 
 
226 aa  169  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  37.56 
 
 
226 aa  165  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  37.75 
 
 
229 aa  153  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  36.45 
 
 
230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  33.17 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 
259 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  38.61 
 
 
269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
227 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.67 
 
 
215 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 
230 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.85 
 
 
243 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 
239 aa  99  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.31 
 
 
233 aa  98.2  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 
246 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  38 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
239 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  29.55 
 
 
273 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  34.23 
 
 
238 aa  95.5  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  32.05 
 
 
236 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
270 aa  95.9  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  34.08 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 
239 aa  95.1  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
271 aa  94.7  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 
230 aa  93.2  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  35.57 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  35.57 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  28.72 
 
 
243 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.52 
 
 
245 aa  91.7  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
247 aa  91.3  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  32.8 
 
 
233 aa  91.3  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  30.66 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
255 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  36.11 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.21 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
254 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
272 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  36.73 
 
 
232 aa  89.4  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
220 aa  89  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  29.86 
 
 
234 aa  88.6  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  31.85 
 
 
267 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.68 
 
 
238 aa  88.2  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
239 aa  88.2  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  29.53 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
255 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  38.6 
 
 
240 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  28.99 
 
 
241 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 
215 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  32.34 
 
 
261 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 
244 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  33.33 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  31.33 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  44.34 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  27.67 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  25.12 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 
231 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  28.37 
 
 
253 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32 
 
 
245 aa  82  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  27 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  25.37 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  27.12 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  29.38 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  27.6 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  28.83 
 
 
244 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  27.75 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.38 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  34.25 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  27.13 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  23.59 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  35.26 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  28.64 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  34.67 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  28 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  30.11 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.75 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  26.56 
 
 
219 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.51 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  33.99 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  34.29 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  31.06 
 
 
299 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  23.92 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  31.68 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  26.21 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  35.83 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>