More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0726 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  56.27 
 
 
599 aa  692    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  69.7 
 
 
598 aa  899    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  51.25 
 
 
602 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  67.51 
 
 
596 aa  858    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  53.82 
 
 
596 aa  647    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
597 aa  1219    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  58.94 
 
 
598 aa  718    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  51 
 
 
603 aa  651    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  51.55 
 
 
615 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  51.38 
 
 
596 aa  592  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  44.46 
 
 
598 aa  500  1e-140  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  41.32 
 
 
629 aa  472  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  41.78 
 
 
616 aa  475  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  41 
 
 
619 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  41.39 
 
 
615 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  41.01 
 
 
631 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  39.94 
 
 
627 aa  458  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  39 
 
 
628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.69 
 
 
628 aa  439  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  37.99 
 
 
607 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.03 
 
 
610 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 
591 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.54 
 
 
641 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  38.41 
 
 
590 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  36.47 
 
 
624 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.76 
 
 
604 aa  375  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 
594 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.06 
 
 
596 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  34.52 
 
 
614 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 
594 aa  369  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.05 
 
 
594 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 
594 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 
594 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.05 
 
 
594 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 
594 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 
594 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 
594 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.54 
 
 
594 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  35.23 
 
 
613 aa  360  5e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  35.47 
 
 
610 aa  360  5e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  34.76 
 
 
598 aa  359  8e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  37.72 
 
 
594 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  38.26 
 
 
593 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  38.26 
 
 
593 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 
517 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.97 
 
 
607 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  32.72 
 
 
675 aa  352  8.999999999999999e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  34.24 
 
 
641 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  32.75 
 
 
656 aa  352  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 
593 aa  351  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  32.96 
 
 
666 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  34.74 
 
 
644 aa  350  5e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 
607 aa  348  1e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  31.99 
 
 
692 aa  349  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  37.55 
 
 
520 aa  349  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  34.45 
 
 
613 aa  348  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 
599 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 
607 aa  348  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  37.59 
 
 
519 aa  347  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  32.55 
 
 
671 aa  347  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  35.39 
 
 
588 aa  346  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  34.1 
 
 
608 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  34.1 
 
 
623 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 
527 aa  345  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  33.07 
 
 
653 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  38.22 
 
 
526 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  33.5 
 
 
650 aa  343  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  33.12 
 
 
690 aa  343  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  32.18 
 
 
670 aa  343  5.999999999999999e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  33.56 
 
 
611 aa  342  9e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  31.57 
 
 
659 aa  342  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 
622 aa  342  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  33.08 
 
 
685 aa  341  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 
620 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  34.03 
 
 
601 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  32.06 
 
 
684 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  35.12 
 
 
595 aa  341  2.9999999999999998e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  32.46 
 
 
613 aa  340  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 
520 aa  340  4e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 
521 aa  340  5e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 
620 aa  339  7e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  33.65 
 
 
627 aa  339  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  34.44 
 
 
610 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  31.57 
 
 
705 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 
609 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  33.01 
 
 
625 aa  338  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  32.05 
 
 
624 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  33.5 
 
 
708 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  32.87 
 
 
638 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  32.96 
 
 
682 aa  337  5e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  33.95 
 
 
676 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  33.55 
 
 
647 aa  336  5.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  34.28 
 
 
610 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  33.95 
 
 
676 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  33.95 
 
 
676 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  32.42 
 
 
649 aa  336  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  34.28 
 
 
610 aa  336  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  34.28 
 
 
610 aa  336  7e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  34.28 
 
 
610 aa  336  7e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  34.28 
 
 
610 aa  336  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>