More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0565 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 
922 aa  1073  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
954 aa  1984  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  41 
 
 
835 aa  677  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
838 aa  733  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 
968 aa  680  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
854 aa  704  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
951 aa  733  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
906 aa  764  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
971 aa  743  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 
1146 aa  948  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
969 aa  716  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
954 aa  721  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
971 aa  743  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  39 
 
 
1064 aa  716  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
949 aa  718  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
958 aa  703  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
949 aa  739  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
934 aa  732  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 
936 aa  1129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 
969 aa  1119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
984 aa  691  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
971 aa  743  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
985 aa  693  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
984 aa  711  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
840 aa  668  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
978 aa  690  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
990 aa  672  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
949 aa  1123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
1016 aa  679  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
982 aa  681  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
952 aa  693  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
829 aa  726  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
858 aa  739  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
925 aa  1065  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  71.56 
 
 
944 aa  1424  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
833 aa  746  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
968 aa  733  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
978 aa  699  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
936 aa  754  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
833 aa  722  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
950 aa  733  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  39.41 
 
 
994 aa  686  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
952 aa  711  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
923 aa  1068  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
963 aa  724  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 
921 aa  1128  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
987 aa  693  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
801 aa  618  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
802 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
819 aa  609  1e-173  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
802 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
802 aa  608  1e-172  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
802 aa  608  1e-172  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
802 aa  606  1e-172  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
802 aa  606  1e-172  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
802 aa  607  1e-172  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
816 aa  607  1e-172  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
802 aa  608  1e-172  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
802 aa  608  1e-172  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
802 aa  608  1e-172  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
802 aa  608  1e-172  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  42.54 
 
 
879 aa  599  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
806 aa  598  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  2.79205e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
857 aa  587  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
804 aa  578  1e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
805 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
805 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
806 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
829 aa  555  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
864 aa  541  1e-152  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
865 aa  542  1e-152  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
875 aa  535  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 
904 aa  529  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  8.64885e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
904 aa  527  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 
872 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
858 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
804 aa  524  1e-147  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
859 aa  523  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
807 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
864 aa  516  1e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
854 aa  518  1e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
805 aa  518  1e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 
864 aa  515  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
805 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
851 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.16015e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
861 aa  511  1e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
807 aa  508  1e-142  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
856 aa  508  1e-142  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
860 aa  507  1e-142  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1376  leucyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
879 aa  506  1e-142  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.264613  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
806 aa  508  1e-142  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1309  leucyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
879 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01874  leucyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
880 aa  505  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
865 aa  506  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
804 aa  503  1e-141  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
862 aa  506  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
865 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
801 aa  504  1e-141  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
872 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 
859 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  5.16313e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>