More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0479 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
268 aa  546  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.06 
 
 
267 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.9 
 
 
265 aa  293  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
268 aa  270  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
268 aa  269  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.54 
 
 
266 aa  268  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.31 
 
 
273 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.78 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.24 
 
 
268 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.43 
 
 
271 aa  238  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 
272 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  41.13 
 
 
244 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
272 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 
276 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
256 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
273 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0196176  normal  0.613777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
249 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
278 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
289 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
247 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
317 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
272 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
247 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
247 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880623  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 
284 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
314 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 
284 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
247 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.505512  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
281 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
286 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 
274 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 
277 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
293 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 
280 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
286 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
249 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.526934  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 
276 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.94 
 
 
273 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
283 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
280 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.19 
 
 
272 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
249 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748494  normal  0.932613 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 
275 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
306 aa  148  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
286 aa  148  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
279 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 
295 aa  148  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0401  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  38.2 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0616963  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
344 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
275 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
276 aa  145  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.98 
 
 
277 aa  145  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
249 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
278 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
267 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
282 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
303 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
249 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564594  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
338 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
272 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 
286 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 
276 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
283 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
280 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
279 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  31.6 
 
 
275 aa  142  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
273 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  40 
 
 
285 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
287 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
272 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
286 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
285 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
277 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
282 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  32.9 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>