More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0474 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.16 
 
 
245 aa  308  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.13 
 
 
246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.72 
 
 
272 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
260 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
245 aa  228  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
246 aa  222  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
242 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
257 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
250 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
251 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  40.51 
 
 
245 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
231 aa  165  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  39.26 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  38.24 
 
 
257 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
241 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
270 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
247 aa  158  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
248 aa  154  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
250 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.34 
 
 
240 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
233 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
236 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
237 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
236 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
232 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
229 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
244 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
237 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
237 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
227 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
238 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 
239 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
231 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
240 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  33.6 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  32.39 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 
232 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.52 
 
 
232 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
243 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.5 
 
 
277 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
236 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
236 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  34.31 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  31.31 
 
 
286 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45918  predicted protein  31.09 
 
 
288 aa  97.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.997663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05379  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 
365 aa  96.3  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.228242  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
244 aa  95.9  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.67 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  31.34 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474555  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07999  conserved hypothetical protein  33.64 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  35 
 
 
291 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
260 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  30.96 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
291 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  34 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
281 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 
260 aa  92.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  30.83 
 
 
243 aa  92.8  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  34.31 
 
 
219 aa  92.4  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 
261 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00525  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  31.5 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
280 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  27.39 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
281 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>