More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0397 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  84.39 
 
 		 205 aa  354  3.9999999999999996e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  79.51 
 
 		 205 aa  340  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  71.22 
 
 		 205 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  68.93 
 
 		 220 aa  292  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  67.32 
 
 		 205 aa  290  1e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  65.53 
 
 		 206 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  65.53 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  60.95 
 
 		 210 aa  270  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  62.93 
 
 		 205 aa  268  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  58.94 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  57.07 
 
 		 209 aa  234  8e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  56.59 
 
 		 209 aa  234  8e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2296  50S ribosomal protein L3  58.05 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600066  hitchhiker  0.00331239 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  56.1 
 
 		 209 aa  231  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  55.61 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 209 aa  225  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 210 aa  221  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 210 aa  216  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  52.2 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 205 aa  205  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  53.2 
 
 		 211 aa  205  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  49.27 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 216 aa  201  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 221 aa  201  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 208 aa  198  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  51.28 
 
 		 209 aa  197  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  52.48 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  52.48 
 
 		 208 aa  195  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  49.27 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 206 aa  195  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  47.8 
 
 		 213 aa  194  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 219 aa  194  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  47.32 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  44.39 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  46.83 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  55.39 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1226  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 		 244 aa  187  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0600156  unclonable  0.00000985108 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 		 216 aa  187  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 209 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  51.24 
 
 		 213 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0192  ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  46.31 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>