More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0381 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  100 
 
 
116 aa  229  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  68.64 
 
 
118 aa  165  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  70 
 
 
117 aa  148  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  62.61 
 
 
117 aa  142  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  59.17 
 
 
117 aa  140  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  2.57389e-05  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  60.68 
 
 
117 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  59.83 
 
 
117 aa  135  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  60.34 
 
 
116 aa  135  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  58.04 
 
 
118 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  59.65 
 
 
114 aa  134  3e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  57.52 
 
 
119 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  57.52 
 
 
119 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
118 aa  134  6e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 
118 aa  131  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.95755e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 
120 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 
120 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  130  8e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  130  8e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  130  8e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  130  8e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  130  8e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  130  8e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  130  8e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  129  1e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  129  1e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 
120 aa  128  2e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  54.46 
 
 
119 aa  129  2e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  51.72 
 
 
116 aa  128  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 
120 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  58.04 
 
 
118 aa  128  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 
119 aa  127  4e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  127  4e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 
119 aa  127  4e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 
120 aa  127  5e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.04342e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 
120 aa  127  5e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  61.17 
 
 
119 aa  127  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 
120 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
119 aa  126  1e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 
120 aa  125  1e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
119 aa  126  1e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 
120 aa  126  1e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 
120 aa  126  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 
120 aa  125  1e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 
119 aa  125  2e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 
121 aa  125  2e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 
120 aa  125  2e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 
120 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 
120 aa  124  4e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  55.26 
 
 
119 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  47.41 
 
 
116 aa  123  7e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  57.14 
 
 
118 aa  123  8e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 
120 aa  122  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  56.25 
 
 
125 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  50 
 
 
122 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 
119 aa  121  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  50.42 
 
 
122 aa  120  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 
119 aa  120  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  50 
 
 
124 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 
121 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  57.27 
 
 
118 aa  119  1e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  54.7 
 
 
120 aa  119  1e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  53.57 
 
 
122 aa  119  1e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  56.86 
 
 
117 aa  119  1e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  50.86 
 
 
116 aa  119  1e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  51.38 
 
 
118 aa  118  2e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.579e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  57.84 
 
 
120 aa  119  2e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
115 aa  118  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  52.83 
 
 
120 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  52.07 
 
 
118 aa  117  5e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 
122 aa  117  5e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  53.04 
 
 
120 aa  117  5e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
122 aa  117  5e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 
122 aa  117  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.55959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 
119 aa  117  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.34169e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  54.21 
 
 
119 aa  116  1e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 
122 aa  116  1e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 
122 aa  116  1e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 
122 aa  116  1e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  54.46 
 
 
122 aa  116  1e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
120 aa  116  1e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
122 aa  115  2e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  46.22 
 
 
122 aa  115  2e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  58.42 
 
 
122 aa  114  4e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  49.14 
 
 
119 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.51304e-08  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  51.35 
 
 
121 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 
122 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 
119 aa  113  7e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  52.34 
 
 
120 aa  113  7e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  50.93 
 
 
114 aa  112  1e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 
122 aa  113  1e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  47.86 
 
 
122 aa  112  1e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  50.47 
 
 
121 aa  112  1e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.62342e-09  hitchhiker  3.24401e-08 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  47.86 
 
 
122 aa  112  2e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 
124 aa  112  2e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 
120 aa  112  2e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  50 
 
 
122 aa  112  2e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
122 aa  111  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  52.21 
 
 
122 aa  111  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  9.83895e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>