More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0364 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
231 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  37.74 
 
 
214 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  37.74 
 
 
214 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  37.74 
 
 
214 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  37.74 
 
 
214 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  36.97 
 
 
215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  36.97 
 
 
215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  36.97 
 
 
215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  36.97 
 
 
215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  36.97 
 
 
215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  36.49 
 
 
215 aa  151  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  36.49 
 
 
215 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.49 
 
 
215 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  36.49 
 
 
215 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  36.49 
 
 
215 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  36.49 
 
 
215 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  36.49 
 
 
215 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  35.96 
 
 
214 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  36.04 
 
 
215 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  36.02 
 
 
215 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  36.02 
 
 
215 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  35.89 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  37.44 
 
 
207 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  33.01 
 
 
212 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  33.33 
 
 
212 aa  138  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  35.78 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  36.82 
 
 
210 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  34.95 
 
 
208 aa  135  7.000000000000001e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.73 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.37 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  33.67 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  34.17 
 
 
212 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.08 
 
 
231 aa  128  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.82 
 
 
218 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  36.82 
 
 
216 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  34.67 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  35.82 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  37.84 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  36.27 
 
 
221 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  36.27 
 
 
221 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  36.14 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  36.14 
 
 
221 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.14 
 
 
221 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  36.14 
 
 
221 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  36.14 
 
 
221 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 
227 aa  124  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  36.82 
 
 
210 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 
213 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  36.14 
 
 
221 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  36.14 
 
 
221 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 
213 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  34.67 
 
 
221 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  34.67 
 
 
221 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  34.67 
 
 
221 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  34.67 
 
 
221 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.1 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  34.17 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.1 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.5 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  34.83 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  33.85 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 
206 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.94 
 
 
217 aa  118  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.19 
 
 
225 aa  118  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.88 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  31 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  31 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  31 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  31 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  31 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  31 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  31 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  31 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.81 
 
 
211 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.81 
 
 
211 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  34 
 
 
229 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.34 
 
 
206 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  35.82 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.18 
 
 
206 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.34 
 
 
206 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.18 
 
 
206 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.82 
 
 
206 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  29.47 
 
 
210 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.34 
 
 
206 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.18 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  34.33 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  33.33 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  33.33 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.15 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.38 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  35.44 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.52 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>