298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0353 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  100 
 
 		 830 aa  1670    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  39.43 
 
 		 823 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  34.19 
 
 		 830 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 800 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  38.1 
 
 		 812 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  33.02 
 
 		 791 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  31.9 
 
 		 824 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  32.16 
 
 		 846 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  29.01 
 
 		 936 aa  278  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  28.63 
 
 		 948 aa  272  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  29.25 
 
 		 833 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  29.26 
 
 		 952 aa  267  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 1055 aa  263  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29.83 
 
 		 781 aa  262  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  29.36 
 
 		 834 aa  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  27.98 
 
 		 827 aa  261  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  27.63 
 
 		 828 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 947 aa  251  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  27.68 
 
 		 977 aa  250  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 828 aa  247  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  26.51 
 
 		 837 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  26.38 
 
 		 837 aa  235  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  27.2 
 
 		 869 aa  234  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 837 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  28.87 
 
 		 940 aa  231  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 828 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  26.32 
 
 		 833 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  31.26 
 
 		 753 aa  201  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 919 aa  194  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 779 aa  192  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  28.55 
 
 		 869 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 910 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 869 aa  184  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  31.18 
 
 		 915 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 922 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.28 
 
 		 920 aa  181  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 920 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 919 aa  179  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 921 aa  177  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 912 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 852 aa  174  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 931 aa  171  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.61 
 
 		 568 aa  170  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  25.23 
 
 		 897 aa  168  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  30.66 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  27.7 
 
 		 875 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.23 
 
 		 877 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.93 
 
 		 800 aa  164  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.7 
 
 		 877 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  33.02 
 
 		 849 aa  162  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.06 
 
 		 576 aa  158  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  27.21 
 
 		 580 aa  141  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  29.54 
 
 		 478 aa  126  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 992 aa  110  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  25.98 
 
 		 992 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.59 
 
 		 552 aa  98.6  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.59 
 
 		 552 aa  97.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  23.49 
 
 		 579 aa  97.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  26.18 
 
 		 551 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.25 
 
 		 552 aa  94.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.5 
 
 		 703 aa  94  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  38.32 
 
 		 425 aa  92.8  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  24.31 
 
 		 609 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.43 
 
 		 552 aa  93.2  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  30.19 
 
 		 317 aa  91.7  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  26.64 
 
 		 605 aa  91.3  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.21 
 
 		 473 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.76 
 
 		 373 aa  90.5  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  24.03 
 
 		 603 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  24.45 
 
 		 587 aa  89.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  29.61 
 
 		 508 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  29.24 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  26.62 
 
 		 347 aa  84  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  26.28 
 
 		 606 aa  82  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  25.68 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 557 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  29.36 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  27.04 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  22.76 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  22.76 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  28.96 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  22.55 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  30.04 
 
 		 282 aa  77  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  28.84 
 
 		 282 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  25.59 
 
 		 700 aa  77  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  25.09 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.08 
 
 		 268 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  30.63 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  26.81 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.51 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  22.28 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>