More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0258 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  51.75 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  50.43 
 
 
230 aa  201  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  45.78 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  48.25 
 
 
225 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  46.84 
 
 
263 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  47.24 
 
 
209 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  43.27 
 
 
233 aa  135  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  44.77 
 
 
229 aa  132  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  46.82 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  42.53 
 
 
229 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  44.3 
 
 
229 aa  123  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  39.01 
 
 
215 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  41.1 
 
 
230 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  41.1 
 
 
230 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  41.1 
 
 
230 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  41.1 
 
 
230 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
220 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
220 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
220 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
220 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
220 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  45.9 
 
 
229 aa  118  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  37.77 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  37.23 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  37.77 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  41.82 
 
 
222 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  43.35 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  37.23 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  44.6 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  43.62 
 
 
229 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 
225 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  39.06 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  46.38 
 
 
224 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  42.77 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  44.93 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.33 
 
 
218 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  37.16 
 
 
215 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  42.14 
 
 
220 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  43.57 
 
 
215 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  44.2 
 
 
228 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  42.14 
 
 
243 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  35.38 
 
 
241 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 
224 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  36.98 
 
 
231 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 
224 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  41.43 
 
 
221 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  44.2 
 
 
230 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 
224 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  44.2 
 
 
230 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
228 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  40.88 
 
 
220 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  39.71 
 
 
217 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  40.97 
 
 
221 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 
230 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  41.18 
 
 
237 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  36.84 
 
 
228 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
228 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  37.13 
 
 
228 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  41.18 
 
 
237 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 
226 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  45.07 
 
 
215 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
224 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  49.5 
 
 
320 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  39.71 
 
 
222 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  40.58 
 
 
219 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 
216 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  40.58 
 
 
219 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  40.58 
 
 
219 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  37.13 
 
 
228 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  44.88 
 
 
537 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 
227 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.31 
 
 
223 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.57 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.03 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  43.59 
 
 
510 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.91 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  37.43 
 
 
227 aa  99.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 
221 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  47.52 
 
 
221 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 
221 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.29 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  40.88 
 
 
236 aa  98.2  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.89 
 
 
205 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.54 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  34.39 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.32 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  36 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 
316 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  42.45 
 
 
890 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  40.11 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  42.06 
 
 
310 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>