63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0239 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  196  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  58.7 
 
 
99 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  58.7 
 
 
98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 
99 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  55.21 
 
 
98 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  51.61 
 
 
99 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0139  transcriptional regulator  62.67 
 
 
80 aa  100  9e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  43.53 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  36.56 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  34.83 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  39.33 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  40.51 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  34.07 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
327 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  38.1 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  34.04 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  32.61 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  41.56 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  37.08 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  37.8 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  30.43 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  40.91 
 
 
325 aa  64.7  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  38.1 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  38.46 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  31.11 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  31.52 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  41.56 
 
 
332 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  31.52 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 
326 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  35.71 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  34.83 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 
330 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  28.89 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0803  hypothetical protein  28.89 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.80068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  28.89 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  34.44 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  28.89 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  28.41 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  35.37 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  31.76 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  27.5 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  32.1 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  37.65 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  33.33 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  29.49 
 
 
97 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  28.74 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  29.79 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  31.46 
 
 
332 aa  47.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  26.53 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  29.63 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0184  regulatory protein, ArsR  26.97 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal  0.871584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  27.66 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  24.72 
 
 
107 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.018451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>