97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0209 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  100 
 
 		 287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  43.33 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  37.09 
 
 		 304 aa  161  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  36.42 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  32.41 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  31.49 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1403  rhomboid family protein  34.39 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  30.89 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  31.58 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1654  hypothetical protein  28.3 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  29.6 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  30.9 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  30.43 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  27.31 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  29.39 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  32.19 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  26.96 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.39 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  34.03 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  33.13 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  24.18 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  27.27 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  28.3 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  35.37 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  32.65 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  25.1 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  31.51 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  27.45 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  30.07 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 492 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  30.41 
 
 		 220 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  29.8 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  27.61 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  28.35 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  29.8 
 
 		 376 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  28.34 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  38.1 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  29.41 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  30.57 
 
 		 206 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  32.38 
 
 		 190 aa  49.3  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 		 625 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  34.44 
 
 		 625 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.44 
 
 		 625 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  28.48 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  31.43 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  28.08 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  32.87 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  28.08 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  32.35 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  38.96 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  29.9 
 
 		 155 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  31.96 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  26.47 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  33.71 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  27.87 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  25.15 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1812  hypothetical protein  20.99 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.515033  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  31.03 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  35.44 
 
 		 515 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  27.04 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  25.13 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  32.22 
 
 		 625 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  31.52 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  27.34 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  32.53 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  27.43 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  30 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  32.82 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  29.27 
 
 		 554 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  27.69 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  28.95 
 
 		 190 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  32.58 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  31.62 
 
 		 230 aa  43.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  22.58 
 
 		 522 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5314  rhomboid family protein  28.66 
 
 		 496 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  26.67 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  26.67 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  30.34 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  34.04 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2217  Rhomboid family protein  27.81 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0928322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  34.04 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  26.67 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  23.75 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  34.04 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  34.04 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  35.8 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  34.04 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  34.12 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  27.55 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  25.29 
 
 		 200 aa  42.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  29.76 
 
 		 267 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  30.5 
 
 		 212 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>