More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0106 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.16 
 
 
645 aa  654    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  70.9 
 
 
545 aa  835    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  100 
 
 
544 aa  1107    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  74.45 
 
 
546 aa  863    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  49.63 
 
 
637 aa  582  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  49.26 
 
 
630 aa  561  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  48.16 
 
 
643 aa  557  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  42.24 
 
 
649 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  40.71 
 
 
649 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
645 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  40.85 
 
 
664 aa  431  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  40.6 
 
 
564 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  41.39 
 
 
645 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  40 
 
 
575 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
767 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  39.89 
 
 
641 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  41.04 
 
 
581 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  39.31 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  38.52 
 
 
668 aa  413  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  41.6 
 
 
638 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
632 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 
545 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  40.41 
 
 
564 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  40.6 
 
 
567 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
648 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  39.67 
 
 
653 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  40.55 
 
 
709 aa  402  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  39.7 
 
 
641 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  40.49 
 
 
648 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  39.51 
 
 
690 aa  402  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  37.22 
 
 
634 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  39.2 
 
 
646 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  37.09 
 
 
688 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  38.93 
 
 
569 aa  395  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  39.53 
 
 
656 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  38.52 
 
 
667 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  37.24 
 
 
685 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  38.17 
 
 
549 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  38.64 
 
 
652 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  37.67 
 
 
540 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  39.07 
 
 
542 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  38.86 
 
 
656 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  37.28 
 
 
540 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  38.1 
 
 
652 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  39.74 
 
 
650 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  37.67 
 
 
540 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  40.37 
 
 
642 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  40.04 
 
 
574 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  39.17 
 
 
544 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  37.98 
 
 
619 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  38.77 
 
 
548 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  38.35 
 
 
650 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
663 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  38.34 
 
 
545 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  37.9 
 
 
667 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.35 
 
 
663 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  37.8 
 
 
672 aa  378  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  37.01 
 
 
635 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  38.39 
 
 
548 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  37.86 
 
 
539 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  38.42 
 
 
540 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  39.26 
 
 
574 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  38.98 
 
 
540 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  38.51 
 
 
548 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  37.81 
 
 
543 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  37.98 
 
 
651 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 
545 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  36.93 
 
 
644 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 
540 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  38.95 
 
 
572 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
641 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  38.8 
 
 
638 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  37.5 
 
 
543 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  39.34 
 
 
572 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  36.21 
 
 
541 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  35.76 
 
 
540 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  37.86 
 
 
540 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  38.06 
 
 
540 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  39.07 
 
 
583 aa  365  1e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  37.09 
 
 
540 aa  364  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  35.89 
 
 
659 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  37.48 
 
 
540 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  37.79 
 
 
540 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  37.02 
 
 
575 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1403  ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 
667 aa  360  4e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  36.1 
 
 
540 aa  359  7e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  37.79 
 
 
540 aa  359  8e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  36.38 
 
 
879 aa  357  2.9999999999999997e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  35.46 
 
 
541 aa  357  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
644 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  35.95 
 
 
540 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  38.45 
 
 
536 aa  356  5e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  36.59 
 
 
639 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
644 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 
659 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
662 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  36.31 
 
 
560 aa  355  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  35.76 
 
 
540 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 
658 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  34.2 
 
 
645 aa  354  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>