216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0044 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 362 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  60.39 
 
 		 359 aa  435  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  52.63 
 
 		 358 aa  337  2.9999999999999997e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  34.53 
 
 		 360 aa  245  8e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  38.12 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  33.43 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  34.17 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  33.15 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  32.22 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  32.49 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.15 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 361 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  20.99 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 		 359 aa  126  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.57 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.19 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.58 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  21.22 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.43 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  22.34 
 
 		 356 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 		 359 aa  89.4  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  22.07 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 		 792 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.63 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.39 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  20.73 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  20.75 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.61 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  20.22 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  22.22 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  20.49 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 1096 aa  72.8  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  20.73 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  19.78 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  22.74 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.13 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  20.75 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  22.16 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  21.31 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  20.99 
 
 		 1061 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  21.25 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  22.82 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  20.71 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  20.71 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  20.71 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  18.75 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  20.99 
 
 		 1061 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  18.75 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  21.81 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  19.78 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  20.88 
 
 		 1111 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  21.76 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  19.83 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  20.44 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  20.23 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  21.98 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  21.55 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  21.26 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  18.65 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  20.68 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  22.04 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.5 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  19.73 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  21.62 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  21.83 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  22.54 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  20.77 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  22.53 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  21.7 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  20.77 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  20.77 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  20.77 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  20.77 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  20.77 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  20.77 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  21.18 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>