More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0041 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  71.12 
 
 
525 aa  712    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  76.94 
 
 
512 aa  801    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  100 
 
 
514 aa  1045    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  56.34 
 
 
513 aa  552  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  54.33 
 
 
509 aa  549  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  52.49 
 
 
529 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  53.57 
 
 
539 aa  535  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  54.6 
 
 
522 aa  522  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  55.56 
 
 
528 aa  498  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  50 
 
 
524 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  47.67 
 
 
446 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  48.74 
 
 
945 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  45.9 
 
 
442 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  46.88 
 
 
445 aa  398  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  44.62 
 
 
449 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
449 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  45.66 
 
 
444 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
453 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
453 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
453 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
453 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
453 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
453 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0264  replicative DNA helicase  41.57 
 
 
507 aa  391  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
453 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0342  replicative DNA helicase  43.88 
 
 
510 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
453 aa  392  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
453 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  44.94 
 
 
448 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1608  DnaB helicase  42.98 
 
 
511 aa  388  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.16 
 
 
462 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  43.05 
 
 
456 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  43.82 
 
 
454 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  44.49 
 
 
454 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  40.74 
 
 
507 aa  385  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  44.02 
 
 
454 aa  385  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  44.74 
 
 
481 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1913  DnaB helicase  43.65 
 
 
511 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  43.05 
 
 
456 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  44.89 
 
 
445 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  44.14 
 
 
440 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  44.2 
 
 
460 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  46.05 
 
 
447 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  43.92 
 
 
468 aa  379  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  43.97 
 
 
460 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  44.59 
 
 
471 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  43.97 
 
 
460 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  44.72 
 
 
442 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  43.21 
 
 
456 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  46.41 
 
 
456 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  43.53 
 
 
460 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  43.33 
 
 
444 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  44.49 
 
 
444 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  44.49 
 
 
439 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  44.4 
 
 
461 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  42.54 
 
 
458 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  45.7 
 
 
461 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  43.69 
 
 
472 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0338  replicative DNA helicase  43.85 
 
 
516 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  43.47 
 
 
471 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
449 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  44.39 
 
 
453 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.05 
 
 
449 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  41.67 
 
 
460 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  42.83 
 
 
459 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  42.02 
 
 
461 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  43.13 
 
 
460 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  43.13 
 
 
460 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  43.69 
 
 
441 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  41.06 
 
 
457 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  44.3 
 
 
446 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  44.99 
 
 
437 aa  365  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  42.63 
 
 
456 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  43.69 
 
 
481 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  43.82 
 
 
450 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  43.89 
 
 
476 aa  364  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  43.29 
 
 
476 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  41.63 
 
 
472 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  42.54 
 
 
446 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  42.7 
 
 
472 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  41.74 
 
 
455 aa  360  4e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
473 aa  360  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  44.68 
 
 
473 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  45 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  45 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  41.59 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  41.52 
 
 
463 aa  357  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  39.78 
 
 
459 aa  357  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  44.82 
 
 
450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  45.98 
 
 
451 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  43.64 
 
 
464 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  44.44 
 
 
444 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  45.73 
 
 
473 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  43.64 
 
 
464 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  42.44 
 
 
471 aa  354  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  43.9 
 
 
465 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0364  replicative DNA helicase  42.73 
 
 
526 aa  355  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  42.44 
 
 
471 aa  354  2e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  40.5 
 
 
472 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  44.35 
 
 
463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>