25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0032 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0032  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 592 aa  1178    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00127267  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0031  putative signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 		 589 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0655535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0030  putative signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 572 aa  329  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4845  putative signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 568 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4858  putative signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 584 aa  257  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  25.13 
 
 		 680 aa  111  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  24.42 
 
 		 673 aa  87  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 680 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  19.39 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  19.49 
 
 		 445 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  30.25 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.78 
 
 		 957 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  20 
 
 		 488 aa  47.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.12 
 
 		 828 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 		 480 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.08 
 
 		 453 aa  45.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 343 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.59 
 
 		 493 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  19.77 
 
 		 380 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  23.93 
 
 		 668 aa  44.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 474 aa  44.3  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  24 
 
 		 738 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  22.11 
 
 		 439 aa  43.9  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 450 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>