More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0016 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 344 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  54.13 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  51.03 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  45.15 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  44.86 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  39.71 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  42.62 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  41.16 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  33.63 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  34.41 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  31.66 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  31.42 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  34.53 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  30.09 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  30.82 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  33.76 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.82 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  40.93 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  27.43 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  34.65 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  34.19 
 
 		 333 aa  133  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  31.39 
 
 		 620 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  30.65 
 
 		 456 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  30.55 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  40.21 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  28.33 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  31.88 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  30.15 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  29.24 
 
 		 467 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  33.81 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  29.24 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  30.52 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  37.62 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  29.59 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  125  8.000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  30.74 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  37.13 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  37.2 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.11 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  30.23 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  31.35 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  29.24 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  28.82 
 
 		 356 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.43 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  28.69 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 425 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  29.87 
 
 		 389 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.11 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  38.86 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  32.52 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  30.55 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  29.68 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  27.01 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  36.41 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  41.34 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  33.21 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.53 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  34.5 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  34.07 
 
 		 599 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  28.82 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  29.39 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  38.27 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  27.78 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  41.24 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  27.93 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  31.29 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  28.82 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  33.21 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  29.17 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  33.97 
 
 		 327 aa  119  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  28.82 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  38.12 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  27.68 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  29.21 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  29.34 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  28.92 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  28.37 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  27.33 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  38.67 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  29.81 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  30.36 
 
 		 442 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0908  aminodeoxychorismate lyase  34.81 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  33.17 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  27.98 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  38.55 
 
 		 414 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  29.81 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2536  aminodeoxychorismate lyase  34.23 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  27.62 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>