42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0008 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  346  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  57.98 
 
 
267 aa  130  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  49.04 
 
 
156 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  42.4 
 
 
379 aa  99.4  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  41.59 
 
 
275 aa  99  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  45.19 
 
 
668 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  38.78 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  36.72 
 
 
274 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  34.78 
 
 
274 aa  87.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  39.42 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  41.12 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  36.28 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  39 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  32.75 
 
 
506 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  35.79 
 
 
276 aa  78.2  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  42.7 
 
 
438 aa  77.8  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  39.39 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  37.23 
 
 
804 aa  70.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  30.43 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  33.33 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  37.78 
 
 
484 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  30.61 
 
 
604 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  33.33 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  37.25 
 
 
489 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  40.22 
 
 
485 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  34.02 
 
 
325 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  37.89 
 
 
279 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  30.3 
 
 
223 aa  62  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  24.34 
 
 
583 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  32.98 
 
 
258 aa  54.7  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  28.45 
 
 
413 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  29.07 
 
 
122 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  30.77 
 
 
283 aa  45.4  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  30.56 
 
 
446 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0189  hypothetical protein  36.92 
 
 
437 aa  44.3  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.562826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  28.46 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  32.1 
 
 
245 aa  43.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  31.08 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  32.5 
 
 
221 aa  42.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  27.06 
 
 
276 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  24.81 
 
 
143 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  23.6 
 
 
259 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>