More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4223 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  86.98 
 
 
196 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  86.98 
 
 
196 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  86.98 
 
 
196 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  76.04 
 
 
196 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  76.04 
 
 
196 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  76.04 
 
 
196 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  76.04 
 
 
196 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  75.52 
 
 
196 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  75.52 
 
 
196 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  75.52 
 
 
196 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  75.52 
 
 
196 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  75.52 
 
 
196 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  68.62 
 
 
191 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  66.49 
 
 
191 aa  259  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  64.89 
 
 
193 aa  259  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  66.14 
 
 
192 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  65.96 
 
 
222 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  63.49 
 
 
193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  64.36 
 
 
191 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  64.89 
 
 
192 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  64.89 
 
 
192 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  58.73 
 
 
198 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  57.73 
 
 
197 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  58.51 
 
 
197 aa  226  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  58.51 
 
 
197 aa  226  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  47.85 
 
 
192 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  46.77 
 
 
189 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  48.37 
 
 
217 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  45.86 
 
 
185 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  44.2 
 
 
212 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  43.55 
 
 
190 aa  148  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  40.72 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  43.01 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  38.83 
 
 
318 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  37.97 
 
 
189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 
195 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.76 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.83 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.6 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.83 
 
 
190 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
186 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 
188 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  36.79 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 
188 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  33.87 
 
 
197 aa  108  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.97 
 
 
192 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 
181 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 
212 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  38.51 
 
 
195 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.76 
 
 
182 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  33.7 
 
 
187 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 
180 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 
199 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  34.05 
 
 
183 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  39.87 
 
 
186 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  36.61 
 
 
184 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  33.69 
 
 
185 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  36.36 
 
 
186 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 
197 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 
197 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 
199 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 
201 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 
201 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.76 
 
 
184 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  31.49 
 
 
184 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  36.07 
 
 
187 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 
183 aa  101  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  34.02 
 
 
188 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  31.18 
 
 
198 aa  101  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  34.22 
 
 
186 aa  101  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.61 
 
 
197 aa  101  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  32.97 
 
 
181 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  35.45 
 
 
214 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.16 
 
 
187 aa  100  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 
185 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  37.91 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  35.11 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  40.27 
 
 
309 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  31.58 
 
 
188 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 
201 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 
187 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  34.07 
 
 
186 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  36.17 
 
 
204 aa  99  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  31.18 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  34.2 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  34.81 
 
 
191 aa  99  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 
185 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  33.15 
 
 
197 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.49 
 
 
197 aa  98.6  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  32.63 
 
 
198 aa  99  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  33.15 
 
 
197 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  33.15 
 
 
197 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 
206 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  31.69 
 
 
185 aa  98.6  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  35.16 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>