54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4125 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_4125  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 		 126 aa  243  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.148775 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4228  ATP synthase I chain  82.54 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03567  hypothetical protein  82.54 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000214026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4182  F0F1 ATP synthase subunit I  82.54 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000328591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  82.54 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000153619  normal  0.0333498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03623  F0F1 ATP synthase subunit I  82.54 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000273392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  82.54 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000721396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3955  F0F1 ATP synthase subunit I  82.54 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0001  F0F1 ATP synthase subunit I  59.68 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174013  hitchhiker  0.0034501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4219  F0F1 ATP synthase subunit I  56.45 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000301046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4183  F0F1 ATP synthase subunit I  56.45 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4209  F0F1 ATP synthase subunit I  55.2 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000251091  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  54.84 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  50.81 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4540  F0F1 ATP synthase subunit I  59.38 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4187  F0F1 ATP synthase subunit I  51.61 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000826403  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4153  ATP synthase F0, I subunit  82.67 
 
 		 75 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000580419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5175  ATP synthase F0, I subunit  84.72 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000733243  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4107  ATP synthase F0, I subunit  84.72 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000123417  normal  0.0706174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  40.98 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  45.24 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  39.42 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  39.82 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  38.02 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  36.89 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  36.21 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  36.21 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  34.48 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  37.39 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  37.39 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  37.39 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  37.39 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  37.39 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  36.52 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  36.52 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  37.39 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  37.38 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  38.55 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  34.71 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  35.54 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4203  ATP synthase F0, I subunit  96.15 
 
 		 41 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4082  ATP synthase F0, I subunit  96.15 
 
 		 41 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4097  ATP synthase F0, I subunit  96.15 
 
 		 41 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  30.4 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  30.4 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4262  ATP synthase F0, I subunit  92.31 
 
 		 41 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0815185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  38.46 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  29.57 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  37.36 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  37.36 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  32.17 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  37.36 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  31.52 
 
 		 134 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2876  ATP synthase I chain  51.11 
 
 		 146 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.794417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>