More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4112 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  100 
 
 		 314 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  83.76 
 
 		 314 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  83.76 
 
 		 314 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  84.14 
 
 		 309 aa  497  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  84.47 
 
 		 309 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  84.42 
 
 		 309 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  84.14 
 
 		 309 aa  497  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  84.74 
 
 		 309 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  84.47 
 
 		 309 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  84.42 
 
 		 309 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  84.47 
 
 		 309 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  84.47 
 
 		 309 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  84.42 
 
 		 309 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  83.82 
 
 		 309 aa  494  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  84.09 
 
 		 309 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  72.13 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  72.13 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  72.13 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  73.38 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  74.34 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  70.53 
 
 		 308 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  71.43 
 
 		 308 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  70.13 
 
 		 310 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  58.42 
 
 		 307 aa  345  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  58.61 
 
 		 308 aa  342  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  59.93 
 
 		 305 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  58.28 
 
 		 305 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  57.76 
 
 		 305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  54.95 
 
 		 317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  58.61 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  49.66 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  49.66 
 
 		 304 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  49.83 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  47.83 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  47.49 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  47.83 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  47.83 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  48.99 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  48.49 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  48.49 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  48.66 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  45.3 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  45.3 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  45.95 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  45.76 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  51.01 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  42.35 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  43.19 
 
 		 310 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  48.49 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  46.08 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  42.19 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  46.18 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  44.34 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  45.75 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  44 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  46.2 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  46.08 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  46.08 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  48.68 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  47.97 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  41.45 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  45.54 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  44.69 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  45.21 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  45.33 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  45.75 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  38.39 
 
 		 345 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  42.62 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  44.52 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  39.8 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  40.8 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  40.8 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  41.58 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  43.93 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  48.65 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  42.52 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  43.29 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  49.5 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  49.5 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  41.64 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  49.51 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  44.59 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  42.47 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  40.33 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  37.21 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  45.57 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  41.26 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  39.6 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  41.75 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43.29 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  41.41 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  43.85 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  41.75 
 
 		 302 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  41.67 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  41.78 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  44.44 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  40.21 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  41.16 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  43.14 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>