More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4094 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  90.44 
 
 
607 aa  1134    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  90.44 
 
 
607 aa  1134    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2746  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 
607 aa  691    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.163334  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  57.33 
 
 
598 aa  690    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  70.02 
 
 
606 aa  873    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  76.45 
 
 
604 aa  958    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  53.31 
 
 
615 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  68.7 
 
 
606 aa  856    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  75.37 
 
 
609 aa  950    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  63.67 
 
 
606 aa  768    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  53.21 
 
 
614 aa  673    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  71.12 
 
 
605 aa  901    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  53.42 
 
 
602 aa  657    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  53.39 
 
 
613 aa  660    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 
608 aa  652    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  75.33 
 
 
603 aa  953    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  70.46 
 
 
606 aa  884    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  53.21 
 
 
614 aa  673    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  53.21 
 
 
614 aa  673    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  53.21 
 
 
614 aa  673    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
608 aa  781    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  67.16 
 
 
608 aa  848    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  67.16 
 
 
608 aa  848    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  70.79 
 
 
606 aa  883    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  67.6 
 
 
615 aa  860    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  59.54 
 
 
613 aa  739    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
608 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  62.75 
 
 
606 aa  766    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.73 
 
 
614 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  61.87 
 
 
610 aa  773    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  56.31 
 
 
614 aa  671    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
607 aa  1245    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
608 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  67.16 
 
 
609 aa  850    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  69.14 
 
 
606 aa  861    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  59.5 
 
 
610 aa  719    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  57.74 
 
 
602 aa  701    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  61.92 
 
 
608 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  55.43 
 
 
608 aa  651    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  74.83 
 
 
609 aa  942    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  62.91 
 
 
608 aa  780    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  75.45 
 
 
607 aa  963    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  57.33 
 
 
598 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  54.47 
 
 
606 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  68.89 
 
 
607 aa  870    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  53.21 
 
 
614 aa  673    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  55.81 
 
 
608 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  75.99 
 
 
603 aa  957    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 
602 aa  658    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  62.64 
 
 
603 aa  782    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  72.77 
 
 
607 aa  921    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  56.64 
 
 
599 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3380  GTP-binding protein TypA  57.8 
 
 
608 aa  707    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465428  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  62.91 
 
 
608 aa  777    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  72.19 
 
 
603 aa  901    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2008  GTP-binding protein TypA  57.76 
 
 
607 aa  712    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  55.12 
 
 
607 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
608 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
608 aa  781    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2137  GTP-binding protein TypA  57.43 
 
 
607 aa  716    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  69 
 
 
608 aa  872    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 
607 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  61.53 
 
 
602 aa  757    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2429  GTP-binding protein TypA  57.92 
 
 
607 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.456233  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  62.58 
 
 
608 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  75.29 
 
 
603 aa  939    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  55.45 
 
 
607 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  68.91 
 
 
608 aa  877    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  55.67 
 
 
627 aa  653    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  69.08 
 
 
615 aa  874    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  63.04 
 
 
607 aa  768    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 
605 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  54.04 
 
 
593 aa  642    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0153  GTP-binding protein TypA  65.18 
 
 
605 aa  815    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  70.39 
 
 
606 aa  877    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  62.25 
 
 
608 aa  768    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  74.21 
 
 
623 aa  942    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  55.17 
 
 
607 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  53.55 
 
 
610 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.39 
 
 
610 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0417  GTP-binding protein  81.67 
 
 
616 aa  1002    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 
609 aa  704    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  75.17 
 
 
603 aa  954    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  75.17 
 
 
603 aa  954    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  70.81 
 
 
602 aa  890    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  74.34 
 
 
603 aa  942    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  65.07 
 
 
608 aa  830    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  62.09 
 
 
608 aa  767    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  71.19 
 
 
605 aa  888    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  53.96 
 
 
613 aa  651    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  62 
 
 
605 aa  745    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  51.91 
 
 
618 aa  638    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 
615 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  54.46 
 
 
615 aa  670    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  62.25 
 
 
608 aa  768    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  62.91 
 
 
608 aa  780    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  66.45 
 
 
611 aa  837    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  75.5 
 
 
603 aa  957    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  52.4 
 
 
602 aa  646    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  56.79 
 
 
601 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>