147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3833 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  100 
 
 
276 aa  564  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  80.43 
 
 
276 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  80.43 
 
 
276 aa  478  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  80.43 
 
 
276 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  80.8 
 
 
276 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  80.43 
 
 
276 aa  478  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  80.43 
 
 
276 aa  478  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  80.43 
 
 
276 aa  478  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  80.43 
 
 
276 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  80.07 
 
 
276 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  79.35 
 
 
276 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  79.35 
 
 
276 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  79.35 
 
 
276 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  79.2 
 
 
274 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  79.2 
 
 
274 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  59.11 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  58.09 
 
 
277 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  56 
 
 
278 aa  318  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  56 
 
 
278 aa  318  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  55.93 
 
 
278 aa  318  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  55.64 
 
 
274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  56.25 
 
 
259 aa  298  7e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  55.23 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  43.75 
 
 
280 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  43.38 
 
 
277 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  43.38 
 
 
280 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  41.79 
 
 
279 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  40.57 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  42.25 
 
 
278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  41.28 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  39.86 
 
 
280 aa  211  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  39.86 
 
 
280 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  40.58 
 
 
280 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  37.72 
 
 
281 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  42.55 
 
 
280 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  37.72 
 
 
281 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  40.81 
 
 
276 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  37.01 
 
 
281 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  39.5 
 
 
278 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  36.88 
 
 
281 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  36.88 
 
 
281 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  39.78 
 
 
279 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  41.09 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  37.64 
 
 
280 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  34.68 
 
 
292 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  35.66 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  31.62 
 
 
287 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  32.87 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  28.33 
 
 
293 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  44.9 
 
 
290 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  33.47 
 
 
289 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  41.91 
 
 
224 aa  99  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  32.81 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  32.84 
 
 
286 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  39.31 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  37.24 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  39.31 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  33.21 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  37.93 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  37.93 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  37.93 
 
 
295 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  39.31 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  40.48 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  28.87 
 
 
356 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  28.12 
 
 
327 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  26.22 
 
 
396 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  31.91 
 
 
358 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  30.56 
 
 
207 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1635  Rhomboid family protein  32.62 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  30.51 
 
 
389 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  27.06 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  25.81 
 
 
226 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  31.32 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  28.73 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  23.81 
 
 
486 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  27.41 
 
 
211 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  29.56 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  32.87 
 
 
430 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  31.91 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  27.71 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  29.41 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  20.14 
 
 
342 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  26.8 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  26.8 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  31.06 
 
 
190 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  33.68 
 
 
230 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  33.68 
 
 
202 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3272  rhomboid-like protein  31.94 
 
 
375 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00126234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  26.76 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  26.67 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  19.79 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  28.76 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  28.81 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  29.67 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  25.15 
 
 
487 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  27.49 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  25.15 
 
 
487 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  30 
 
 
197 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  27.94 
 
 
182 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>