More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3347 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  94.19 
 
 
464 aa  870    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  93.98 
 
 
464 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  100 
 
 
465 aa  944    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  82 
 
 
468 aa  787    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  94.19 
 
 
464 aa  870    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  94.19 
 
 
464 aa  870    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  70.47 
 
 
476 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  94.19 
 
 
464 aa  870    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  93.98 
 
 
464 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  93.76 
 
 
464 aa  867    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  93.98 
 
 
464 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  94.19 
 
 
464 aa  870    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  93.98 
 
 
464 aa  868    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  93.98 
 
 
464 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  93.98 
 
 
464 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  94.19 
 
 
464 aa  870    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  94.19 
 
 
464 aa  870    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  65.93 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  65.71 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  66.15 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  66.15 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  66.15 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  65.49 
 
 
472 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  65.49 
 
 
472 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  65.93 
 
 
472 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  65.71 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  65.49 
 
 
472 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  66.15 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  65.27 
 
 
472 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  65.49 
 
 
472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  64.52 
 
 
471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  65.71 
 
 
472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  57.75 
 
 
472 aa  525  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  51.62 
 
 
480 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  43.09 
 
 
480 aa  330  4e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  41.29 
 
 
477 aa  330  4e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  40.22 
 
 
463 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  40.22 
 
 
463 aa  317  4e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1362  sugar transporter  42.56 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  42.59 
 
 
468 aa  298  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  37.33 
 
 
458 aa  285  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.63 
 
 
448 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.1 
 
 
492 aa  276  7e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.76 
 
 
468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  37.04 
 
 
480 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  37.53 
 
 
446 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  39.73 
 
 
447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  33.69 
 
 
473 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  36.48 
 
 
497 aa  269  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  38.51 
 
 
474 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  36.3 
 
 
472 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  33.19 
 
 
473 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  35.67 
 
 
533 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  35.07 
 
 
475 aa  263  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  37.28 
 
 
516 aa  262  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  35.68 
 
 
452 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  34.36 
 
 
485 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  35.68 
 
 
452 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  34.9 
 
 
482 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  36.23 
 
 
477 aa  259  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  38.19 
 
 
475 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  40.09 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  33.71 
 
 
507 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  33.86 
 
 
450 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  34.19 
 
 
475 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  35.65 
 
 
473 aa  250  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  33.85 
 
 
466 aa  249  6e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  34.83 
 
 
480 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  34.43 
 
 
450 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  35.43 
 
 
473 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  35.79 
 
 
444 aa  246  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  35.51 
 
 
484 aa  246  8e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  35.59 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  33.19 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  34.55 
 
 
482 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  35.71 
 
 
468 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  33.7 
 
 
452 aa  243  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.78 
 
 
457 aa  243  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  34.8 
 
 
490 aa  242  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  32.96 
 
 
464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  33.99 
 
 
459 aa  239  5.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  32.75 
 
 
471 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  35.13 
 
 
464 aa  239  6.999999999999999e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  35.87 
 
 
457 aa  239  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  34.08 
 
 
491 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  32.19 
 
 
477 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0826  sugar transporter  35.12 
 
 
444 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  32.54 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  32.54 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.51 
 
 
442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  32.42 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  33.92 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  33.26 
 
 
544 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  34.58 
 
 
467 aa  233  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  34.77 
 
 
438 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  33.71 
 
 
482 aa  230  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  33.12 
 
 
491 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  32.57 
 
 
491 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  32.28 
 
 
448 aa  229  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  33.26 
 
 
471 aa  229  8e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>