More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3028 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3028  DNA-binding transcriptional regulator IscR  100 
 
 
163 aa  330  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  5.15775e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2699  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.51 
 
 
164 aa  281  3e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  6.74586e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2744  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.51 
 
 
164 aa  280  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00512244  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2785  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.51 
 
 
164 aa  280  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000620626  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2806  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.51 
 
 
164 aa  280  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.286562  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2919  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.51 
 
 
164 aa  280  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0662374  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2684  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.48 
 
 
162 aa  278  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3763  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.48 
 
 
162 aa  278  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000105589  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2906  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.48 
 
 
162 aa  278  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00148392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02423  DNA-binding transcriptional repressor  94.48 
 
 
162 aa  278  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2816  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.48 
 
 
162 aa  278  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00041357  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02387  hypothetical protein  94.48 
 
 
162 aa  278  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1137  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  94.48 
 
 
162 aa  278  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554552  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1146  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.48 
 
 
162 aa  277  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0117595  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2682  DNA-binding transcriptional regulator IscR  94.48 
 
 
162 aa  277  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0012048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1275  DNA-binding transcriptional regulator IscR  78.79 
 
 
185 aa  266  9e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.4653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3628  DNA-binding transcriptional regulator IscR  80.61 
 
 
164 aa  266  9e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000895499  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1103  DNA-binding transcriptional regulator IscR  80 
 
 
164 aa  265  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00126529  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1167  DNA-binding transcriptional regulator IscR  78.79 
 
 
164 aa  265  3e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000157606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0436  DNA-binding transcriptional regulator IscR  78.79 
 
 
164 aa  265  3e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.233934  hitchhiker  0.000107797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3032  DNA-binding transcriptional regulator IscR  80.61 
 
 
164 aa  263  6e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.178839  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2752  DNA-binding transcriptional regulator IscR  80 
 
 
164 aa  263  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0761985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1243  DNA-binding transcriptional regulator IscR  80 
 
 
164 aa  261  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510917  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01054  hypothetical protein  78.87 
 
 
168 aa  235  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01355  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  68.94 
 
 
161 aa  233  1e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0210581  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0276  hypothetical protein  77.24 
 
 
188 aa  233  1e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00556967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0716  HTH-type transcriptional regulator  75.35 
 
 
168 aa  218  2e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  69.08 
 
 
153 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.675644  hitchhiker  1.82952e-08 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004361  iron-sulfur cluster regulator IscR  76.52 
 
 
158 aa  213  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1775  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  68.42 
 
 
153 aa  213  1e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175223  hitchhiker  0.000151325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2318  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  68.42 
 
 
153 aa  212  2e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0363364  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  71.13 
 
 
153 aa  210  6e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2847  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  68.53 
 
 
178 aa  209  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1237  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  71.13 
 
 
161 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00337607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2425  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  67.76 
 
 
153 aa  208  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1292  Rrf2 family protein  66.01 
 
 
153 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418655  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1131  Rrf2 family protein  70.42 
 
 
168 aa  205  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2150  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.1 
 
 
153 aa  204  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00595476  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2263  Rrf2 family protein  65.1 
 
 
153 aa  204  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2387  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.1 
 
 
153 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.99976e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2398  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.1 
 
 
153 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00199156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2281  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.1 
 
 
153 aa  204  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00598103  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1738  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.1 
 
 
153 aa  204  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.71223e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2503  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.1 
 
 
153 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000333652  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1818  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.1 
 
 
153 aa  204  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131743  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1960  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  65.1 
 
 
153 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00367756  hitchhiker  0.00162465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1457  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  67.61 
 
 
153 aa  202  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0691454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4613  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  66.2 
 
 
163 aa  196  1e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156233  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1236  transcription factor IscR  66.2 
 
 
163 aa  196  1e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507944  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1422  rrf2 family protein  66.2 
 
 
163 aa  196  1e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3512  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  66.9 
 
 
165 aa  196  2e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112818  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1323  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  65.1 
 
 
158 aa  196  2e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  9.41019e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1298  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  61.39 
 
 
163 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14710  putative Rrf2 family protein  61.39 
 
 
163 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259526  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0884  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  66.2 
 
 
182 aa  194  4e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360129  hitchhiker  0.00284827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0841  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.49 
 
 
163 aa  193  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0871  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.49 
 
 
182 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1486  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  63.38 
 
 
158 aa  191  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000176425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1343  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  61.74 
 
 
162 aa  191  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.34779e-07 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2060  iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  59.62 
 
 
162 aa  190  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0325541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1121  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  58.13 
 
 
165 aa  190  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0280  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  66.92 
 
 
135 aa  189  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1648  Iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  65.25 
 
 
166 aa  189  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.223295  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1412  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  60.96 
 
 
164 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.612266  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40410  Iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  65.22 
 
 
164 aa  187  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1887  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  62.68 
 
 
158 aa  187  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.342013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1326  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  60.56 
 
 
159 aa  183  1e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0470001  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2883  Rrf2 family protein  57.05 
 
 
162 aa  180  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2189  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  56.67 
 
 
167 aa  174  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  62.41 
 
 
156 aa  175  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  3.46494e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56 
 
 
170 aa  173  1e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0803852  hitchhiker  0.00053994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1655  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  57.53 
 
 
170 aa  172  1e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00267813  unclonable  4.98182e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4337  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  63.57 
 
 
150 aa  170  8e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.365662  hitchhiker  1.21629e-09 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0617  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  59.54 
 
 
142 aa  170  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.51443e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0829  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  57.46 
 
 
164 aa  168  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0674  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.34 
 
 
157 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.50812e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  58.78 
 
 
172 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  9.40296e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  58.96 
 
 
153 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  4.54822e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2141  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  58.21 
 
 
178 aa  165  3e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.426314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2145  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  57.46 
 
 
178 aa  163  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000992701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1637  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  57.46 
 
 
178 aa  163  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2177  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  57.46 
 
 
178 aa  163  1e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00333036  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2176  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  55.97 
 
 
178 aa  162  1e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  5.32163e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2291  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.72 
 
 
178 aa  162  2e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  4.27362e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4000  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  57.46 
 
 
178 aa  162  2e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269761  normal  0.0270518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2442  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.72 
 
 
178 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2263  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  57.78 
 
 
177 aa  161  4e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2372  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  57.46 
 
 
179 aa  160  5e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1024  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.41 
 
 
184 aa  160  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591774  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1057  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.41 
 
 
186 aa  160  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0533537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  54.74 
 
 
176 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157881  hitchhiker  0.000462534 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3102  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  54.74 
 
 
179 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2218  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  54.74 
 
 
179 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1709  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  54.74 
 
 
179 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2734  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  54.74 
 
 
179 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2600  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  54.74 
 
 
179 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0660121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2656  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  54.74 
 
 
179 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1490  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  54.74 
 
 
179 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1552  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.74 
 
 
176 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00106628  normal  0.0365649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1459  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.74 
 
 
174 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>