48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2973 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2973  lipoprotein  100 
 
 
344 aa  700    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.500746 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1192  NlpBDapX family lipoprotein  86.05 
 
 
344 aa  621  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02331  hypothetical protein  86.05 
 
 
344 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2854  lipoprotein  86.63 
 
 
344 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2633  lipoprotein  86.92 
 
 
344 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2722  lipoprotein  86.92 
 
 
344 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12688  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2747  lipoprotein  86.92 
 
 
344 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2681  lipoprotein  86.92 
 
 
344 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2624  lipoprotein  86.05 
 
 
344 aa  621  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1199  lipoprotein  86.05 
 
 
344 aa  621  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02369  lipoprotein  86.05 
 
 
344 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2759  lipoprotein  86.05 
 
 
344 aa  621  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2609  lipoprotein  86.05 
 
 
344 aa  621  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3699  lipoprotein  85.47 
 
 
344 aa  617  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2849  lipoprotein  84.59 
 
 
344 aa  614  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3508  lipoprotein  62.54 
 
 
350 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1140  lipoprotein  62.9 
 
 
345 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1073  lipoprotein  60 
 
 
346 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3178  lipoprotein  62.61 
 
 
345 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0463443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1248  lipoprotein  62.9 
 
 
352 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1363  lipoprotein  62.9 
 
 
352 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.206221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3133  lipoprotein  63.19 
 
 
352 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2983  lipoprotein  58.26 
 
 
346 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2378  lipoprotein  33.73 
 
 
350 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03186  lipoprotein  28.48 
 
 
339 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002794  NlpB lipoprotein component of the protein assembly complex  29.75 
 
 
339 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1737  lipoprotein  28.88 
 
 
339 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  28.91 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  26.14 
 
 
365 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  25.98 
 
 
365 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  25.83 
 
 
365 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  27.05 
 
 
365 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  25.98 
 
 
365 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  25.23 
 
 
365 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  26.46 
 
 
365 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  26.14 
 
 
365 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  26.14 
 
 
365 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  26.14 
 
 
365 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  24.93 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  26.76 
 
 
373 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  26.45 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  26.2 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  22.64 
 
 
368 aa  89.4  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  25.45 
 
 
371 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  25.46 
 
 
372 aa  85.9  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1861  NlpB/DapX family lipoprotein  21.67 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127123  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  25.82 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  21.47 
 
 
374 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>