167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2894 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1615  Radical SAM domain protein  71.98 
 
 
464 aa  712  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2894  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
462 aa  964  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00476691  normal  0.460921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1714  Radical SAM domain protein  72.63 
 
 
464 aa  716  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2251  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 
462 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.677683 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  35.65 
 
 
484 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0737  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 
480 aa  263  5e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  32.15 
 
 
487 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 
327 aa  63.2  1e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  28.94 
 
 
356 aa  62.4  2e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  20.92 
 
 
457 aa  62  2e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  29.7 
 
 
369 aa  60.8  5e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
344 aa  59.7  1e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 
399 aa  58.9  2e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
442 aa  58.5  2e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
442 aa  58.5  2e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 
454 aa  58.2  3e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 
365 aa  57.8  4e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 
384 aa  57.4  5e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.79 
 
 
476 aa  57.4  5e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
380 aa  57.4  6e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  26.05 
 
 
388 aa  57  6e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 
476 aa  57  7e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
455 aa  57  7e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 
476 aa  56.6  9e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  20.87 
 
 
471 aa  55.8  1e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 
470 aa  55.8  2e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 
476 aa  55.5  2e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
460 aa  55.8  2e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
476 aa  55.8  2e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 
351 aa  55.8  2e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  19.47 
 
 
463 aa  55.5  2e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 
381 aa  55.1  3e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 
414 aa  54.7  3e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 
290 aa  54.3  4e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
439 aa  54.3  5e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  21.29 
 
 
447 aa  53.9  5e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 
453 aa  53.5  7e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  22.43 
 
 
474 aa  53.5  8e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 
468 aa  53.5  8e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  22.74 
 
 
377 aa  53.5  8e-06  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 
518 aa  52.8  1e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  21.55 
 
 
477 aa  53.1  1e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  24.88 
 
 
338 aa  53.1  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  23.19 
 
 
372 aa  53.1  1e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 
397 aa  52.8  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 
410 aa  53.1  1e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 
461 aa  53.1  1e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  6.86349e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 
464 aa  53.1  1e-05  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 
368 aa  52.8  1e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  24.88 
 
 
338 aa  53.1  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.17 
 
 
394 aa  52.8  1e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 
354 aa  52.4  2e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  5.19465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
486 aa  52  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 
380 aa  52  2e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 
323 aa  52  2e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 
323 aa  52  2e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 
393 aa  52.4  2e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  29.32 
 
 
483 aa  51.2  3e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 
382 aa  51.2  4e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 
389 aa  51.2  4e-05  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 
462 aa  50.8  4e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 
447 aa  50.8  5e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  20.35 
 
 
476 aa  50.8  6e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.20499e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 
465 aa  50.8  6e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.36766e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  24.64 
 
 
399 aa  50.8  6e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  30 
 
 
477 aa  50.8  6e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  22.54 
 
 
382 aa  50.4  6e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 
468 aa  50.4  7e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 
477 aa  50.4  7e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 
394 aa  50.4  7e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 
510 aa  50.1  8e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  32.52 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  21.82 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 
378 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  26.54 
 
 
332 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.26988e-06 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  26.18 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  22.53 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  21.45 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  19.49 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  28.46 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 
326 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  21.72 
 
 
460 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  25.73 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0509  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.94869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 
349 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  20.89 
 
 
347 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 
462 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  22.47 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 
458 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  7.51779e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 
367 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  25.11 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  28.57 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 
459 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>