38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2607 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  362  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  50.91 
 
 
380 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  53.06 
 
 
282 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  51.55 
 
 
284 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  46.6 
 
 
184 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  47 
 
 
227 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  44.55 
 
 
207 aa  95.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  54.55 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  46.24 
 
 
276 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  34.38 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  38.74 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  42.31 
 
 
231 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  40.95 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  42.57 
 
 
200 aa  77.4  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  36.29 
 
 
232 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  40.57 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  39.25 
 
 
311 aa  67  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  36.79 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  37.74 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  45.07 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  37.19 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  34.92 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  45.59 
 
 
72 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  36.11 
 
 
204 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  27.17 
 
 
259 aa  62  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  34.91 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  30.32 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  36.99 
 
 
91 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  30.3 
 
 
241 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  33.08 
 
 
245 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  32.14 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  26.85 
 
 
243 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  26.85 
 
 
250 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  26.04 
 
 
252 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  25.53 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  25.53 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  32.41 
 
 
290 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  27.03 
 
 
236 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>